Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fip1l1Q9D824 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fip1l1Q9D824 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fip1l1Q9D824 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fip1l1Q9D824 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fip1l1Q9D824 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fip1l1Q9D824 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fip1l1Q9D824 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fip1l1Q9D824 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fip1l1Q9D824 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fip1l1Q9D824 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fip1l1Q9D824 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fip1l1Q9D824 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fip1l1Q9D824 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fip1l1Q9D824 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fip1l1Q9D824 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fip1l1Q9D824 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fip1l1Q9D824 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fip1l1Q9D824 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fip1l1Q9D824 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fip1l1Q9D824 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fip1l1Q9D824 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fip1l1Q9D824 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fip1l1Q9D824 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fip1l1Q9D824 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fip1l1Q9D824 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fip1l1Q9D824 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fip1l1Q9D824 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fip1l1Q9D824 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fip1l1Q9D824 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fip1l1Q9D824 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fip1l1Q9D824 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fip1l1Q9D824 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fip1l1Q9D824 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fip1l1Q9D824 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fip1l1Q9D824 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fip1l1Q9D824 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fip1l1Q9D824 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fip1l1Q9D824 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fip1l1Q9D824 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fip1l1Q9D824 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fip1l1Q9D824 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Fip1l1Q9D824 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fip1l1Q9D824 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fip1l1Q9D824 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fip1l1Q9D824 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fip1l1Q9D824 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fip1l1Q9D824 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fip1l1Q9D824 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fip1l1Q9D824 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fip1l1Q9D824 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fip1l1Q9D824 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fip1l1Q9D824 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fip1l1Q9D824 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fip1l1Q9D824 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fip1l1Q9D824 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fip1l1Q9D824 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fip1l1Q9D824 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fip1l1Q9D824 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fip1l1Q9D824 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fip1l1Q9D824 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fip1l1Q9D824 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fip1l1Q9D824 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fip1l1Q9D824 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fip1l1Q9D824 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fip1l1Q9D824 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fip1l1Q9D824 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fip1l1Q9D824 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fip1l1Q9D824 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fip1l1Q9D824 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fip1l1Q9D824 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Fip1l1Q9D824 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fip1l1Q9D824 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fip1l1Q9D824 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fip1l1Q9D824 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fip1l1Q9D824 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fip1l1Q9D824 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fip1l1Q9D824 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fip1l1Q9D824 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fip1l1Q9D824 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fip1l1Q9D824 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fip1l1Q9D824 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fip1l1Q9D824 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fip1l1Q9D824 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fip1l1Q9D824 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fip1l1Q9D824 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fip1l1Q9D824 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fip1l1Q9D824 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fip1l1Q9D824 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fip1l1Q9D824 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fip1l1Q9D824 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fip1l1Q9D824 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fip1l1Q9D824 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fip1l1Q9D824 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Fip1l1Q9D824 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fip1l1Q9D824 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fip1l1Q9D824 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fip1l1Q9D824 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fip1l1Q9D824 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fip1l1Q9D824 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms