Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tubb4aQ9D6F9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tubb4aQ9D6F9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tubb4aQ9D6F9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tubb4aQ9D6F9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tubb4aQ9D6F9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tubb4aQ9D6F9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tubb4aQ9D6F9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tubb4aQ9D6F9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Tubb4aQ9D6F9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tubb4aQ9D6F9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tubb4aQ9D6F9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tubb4aQ9D6F9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tubb4aQ9D6F9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tubb4aQ9D6F9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tubb4aQ9D6F9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tubb4aQ9D6F9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tubb4aQ9D6F9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tubb4aQ9D6F9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tubb4aQ9D6F9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tubb4aQ9D6F9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tubb4aQ9D6F9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tubb4aQ9D6F9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tubb4aQ9D6F9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tubb4aQ9D6F9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tubb4aQ9D6F9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tubb4aQ9D6F9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tubb4aQ9D6F9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tubb4aQ9D6F9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tubb4aQ9D6F9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tubb4aQ9D6F9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tubb4aQ9D6F9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tubb4aQ9D6F9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tubb4aQ9D6F9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tubb4aQ9D6F9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tubb4aQ9D6F9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tubb4aQ9D6F9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tubb4aQ9D6F9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tubb4aQ9D6F9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Tubb4aQ9D6F9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tubb4aQ9D6F9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tubb4aQ9D6F9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tubb4aQ9D6F9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tubb4aQ9D6F9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tubb4aQ9D6F9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Tubb4aQ9D6F9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tubb4aQ9D6F9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tubb4aQ9D6F9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Tubb4aQ9D6F9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tubb4aQ9D6F9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tubb4aQ9D6F9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tubb4aQ9D6F9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tubb4aQ9D6F9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tubb4aQ9D6F9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tubb4aQ9D6F9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tubb4aQ9D6F9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tubb4aQ9D6F9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tubb4aQ9D6F9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tubb4aQ9D6F9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tubb4aQ9D6F9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tubb4aQ9D6F9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tubb4aQ9D6F9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tubb4aQ9D6F9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tubb4aQ9D6F9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tubb4aQ9D6F9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tubb4aQ9D6F9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tubb4aQ9D6F9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tubb4aQ9D6F9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tubb4aQ9D6F9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tubb4aQ9D6F9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tubb4aQ9D6F9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tubb4aQ9D6F9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tubb4aQ9D6F9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tubb4aQ9D6F9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tubb4aQ9D6F9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tubb4aQ9D6F9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tubb4aQ9D6F9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tubb4aQ9D6F9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tubb4aQ9D6F9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tubb4aQ9D6F9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tubb4aQ9D6F9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tubb4aQ9D6F9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tubb4aQ9D6F9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tubb4aQ9D6F9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tubb4aQ9D6F9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tubb4aQ9D6F9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubb4aQ9D6F9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubb4aQ9D6F9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubb4aQ9D6F9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubb4aQ9D6F9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubb4aQ9D6F9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tubb4aQ9D6F9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tubb4aQ9D6F9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tubb4aQ9D6F9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tubb4aQ9D6F9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tubb4aQ9D6F9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms