Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930564D02RikQ9D4S4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930564D02RikQ9D4S4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930564D02RikQ9D4S4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930564D02RikQ9D4S4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930564D02RikQ9D4S4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930564D02RikQ9D4S4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930564D02RikQ9D4S4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930564D02RikQ9D4S4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930564D02RikQ9D4S4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930564D02RikQ9D4S4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930564D02RikQ9D4S4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
4930564D02RikQ9D4S4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930564D02RikQ9D4S4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
4930564D02RikQ9D4S4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930564D02RikQ9D4S4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930564D02RikQ9D4S4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930564D02RikQ9D4S4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
4930564D02RikQ9D4S4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930564D02RikQ9D4S4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
4930564D02RikQ9D4S4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930564D02RikQ9D4S4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930564D02RikQ9D4S4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930564D02RikQ9D4S4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930564D02RikQ9D4S4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930564D02RikQ9D4S4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
4930564D02RikQ9D4S4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930564D02RikQ9D4S4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930564D02RikQ9D4S4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930564D02RikQ9D4S4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930564D02RikQ9D4S4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930564D02RikQ9D4S4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930564D02RikQ9D4S4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930564D02RikQ9D4S4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930564D02RikQ9D4S4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930564D02RikQ9D4S4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930564D02RikQ9D4S4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
4930564D02RikQ9D4S4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930564D02RikQ9D4S4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930564D02RikQ9D4S4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930564D02RikQ9D4S4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930564D02RikQ9D4S4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930564D02RikQ9D4S4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
4930564D02RikQ9D4S4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms