Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf128Q9D304 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf128Q9D304 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf128Q9D304 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf128Q9D304 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf128Q9D304 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf128Q9D304 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf128Q9D304 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf128Q9D304 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf128Q9D304 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf128Q9D304 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf128Q9D304 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf128Q9D304 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf128Q9D304 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf128Q9D304 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf128Q9D304 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf128Q9D304 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf128Q9D304 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf128Q9D304 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf128Q9D304 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf128Q9D304 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf128Q9D304 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf128Q9D304 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf128Q9D304 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf128Q9D304 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf128Q9D304 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf128Q9D304 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf128Q9D304 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf128Q9D304 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf128Q9D304 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf128Q9D304 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf128Q9D304 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf128Q9D304 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf128Q9D304 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf128Q9D304 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf128Q9D304 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf128Q9D304 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf128Q9D304 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf128Q9D304 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf128Q9D304 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf128Q9D304 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf128Q9D304 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf128Q9D304 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf128Q9D304 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf128Q9D304 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf128Q9D304 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf128Q9D304 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf128Q9D304 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf128Q9D304 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf128Q9D304 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf128Q9D304 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf128Q9D304 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf128Q9D304 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf128Q9D304 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf128Q9D304 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf128Q9D304 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf128Q9D304 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf128Q9D304 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf128Q9D304 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf128Q9D304 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf128Q9D304 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf128Q9D304 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf128Q9D304 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf128Q9D304 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf128Q9D304 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf128Q9D304 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf128Q9D304 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf128Q9D304 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf128Q9D304 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf128Q9D304 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf128Q9D304 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf128Q9D304 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf128Q9D304 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf128Q9D304 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf128Q9D304 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf128Q9D304 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rnf128Q9D304 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf128Q9D304 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf128Q9D304 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf128Q9D304 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf128Q9D304 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf128Q9D304 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf128Q9D304 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf128Q9D304 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf128Q9D304 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf128Q9D304 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf128Q9D304 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf128Q9D304 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf128Q9D304 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf128Q9D304 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf128Q9D304 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf128Q9D304 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf128Q9D304 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf128Q9D304 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf128Q9D304 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf128Q9D304 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf128Q9D304 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf128Q9D304 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf128Q9D304 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf128Q9D304 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms