Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Klhdc8bQ9D2D9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Klhdc8bQ9D2D9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Klhdc8bQ9D2D9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Klhdc8bQ9D2D9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Klhdc8bQ9D2D9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Klhdc8bQ9D2D9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Klhdc8bQ9D2D9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Klhdc8bQ9D2D9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Klhdc8bQ9D2D9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Klhdc8bQ9D2D9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Klhdc8bQ9D2D9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Klhdc8bQ9D2D9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Klhdc8bQ9D2D9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Klhdc8bQ9D2D9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Klhdc8bQ9D2D9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Klhdc8bQ9D2D9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Klhdc8bQ9D2D9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Klhdc8bQ9D2D9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Klhdc8bQ9D2D9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Klhdc8bQ9D2D9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhdc8bQ9D2D9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhdc8bQ9D2D9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Klhdc8bQ9D2D9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Klhdc8bQ9D2D9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Klhdc8bQ9D2D9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Klhdc8bQ9D2D9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Klhdc8bQ9D2D9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Klhdc8bQ9D2D9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Klhdc8bQ9D2D9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Klhdc8bQ9D2D9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Klhdc8bQ9D2D9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Klhdc8bQ9D2D9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Klhdc8bQ9D2D9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Klhdc8bQ9D2D9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Klhdc8bQ9D2D9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Klhdc8bQ9D2D9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Klhdc8bQ9D2D9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Klhdc8bQ9D2D9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klhdc8bQ9D2D9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klhdc8bQ9D2D9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klhdc8bQ9D2D9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klhdc8bQ9D2D9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Klhdc8bQ9D2D9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Klhdc8bQ9D2D9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klhdc8bQ9D2D9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klhdc8bQ9D2D9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Klhdc8bQ9D2D9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klhdc8bQ9D2D9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klhdc8bQ9D2D9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms