Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SarnpQ9D1J3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SarnpQ9D1J3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SarnpQ9D1J3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SarnpQ9D1J3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SarnpQ9D1J3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SarnpQ9D1J3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SarnpQ9D1J3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SarnpQ9D1J3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SarnpQ9D1J3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SarnpQ9D1J3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SarnpQ9D1J3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SarnpQ9D1J3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SarnpQ9D1J3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SarnpQ9D1J3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SarnpQ9D1J3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SarnpQ9D1J3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SarnpQ9D1J3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SarnpQ9D1J3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SarnpQ9D1J3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SarnpQ9D1J3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SarnpQ9D1J3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SarnpQ9D1J3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SarnpQ9D1J3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SarnpQ9D1J3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SarnpQ9D1J3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SarnpQ9D1J3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SarnpQ9D1J3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SarnpQ9D1J3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SarnpQ9D1J3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SarnpQ9D1J3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SarnpQ9D1J3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SarnpQ9D1J3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SarnpQ9D1J3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SarnpQ9D1J3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SarnpQ9D1J3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SarnpQ9D1J3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SarnpQ9D1J3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SarnpQ9D1J3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SarnpQ9D1J3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SarnpQ9D1J3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SarnpQ9D1J3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SarnpQ9D1J3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SarnpQ9D1J3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SarnpQ9D1J3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SarnpQ9D1J3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SarnpQ9D1J3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SarnpQ9D1J3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SarnpQ9D1J3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SarnpQ9D1J3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SarnpQ9D1J3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SarnpQ9D1J3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SarnpQ9D1J3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SarnpQ9D1J3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SarnpQ9D1J3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SarnpQ9D1J3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SarnpQ9D1J3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SarnpQ9D1J3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SarnpQ9D1J3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SarnpQ9D1J3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SarnpQ9D1J3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SarnpQ9D1J3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SarnpQ9D1J3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SarnpQ9D1J3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SarnpQ9D1J3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SarnpQ9D1J3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SarnpQ9D1J3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SarnpQ9D1J3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SarnpQ9D1J3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SarnpQ9D1J3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SarnpQ9D1J3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SarnpQ9D1J3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SarnpQ9D1J3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SarnpQ9D1J3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SarnpQ9D1J3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SarnpQ9D1J3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SarnpQ9D1J3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SarnpQ9D1J3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SarnpQ9D1J3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SarnpQ9D1J3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SarnpQ9D1J3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SarnpQ9D1J3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SarnpQ9D1J3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SarnpQ9D1J3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SarnpQ9D1J3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SarnpQ9D1J3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SarnpQ9D1J3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SarnpQ9D1J3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SarnpQ9D1J3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SarnpQ9D1J3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SarnpQ9D1J3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SarnpQ9D1J3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SarnpQ9D1J3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SarnpQ9D1J3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SarnpQ9D1J3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SarnpQ9D1J3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SarnpQ9D1J3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SarnpQ9D1J3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SarnpQ9D1J3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SarnpQ9D1J3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms