Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0S4

Neurl2, Neuralized-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl2Q9D0S4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurl2Q9D0S4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurl2Q9D0S4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurl2Q9D0S4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurl2Q9D0S4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurl2Q9D0S4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurl2Q9D0S4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurl2Q9D0S4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Neurl2Q9D0S4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Neurl2Q9D0S4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurl2Q9D0S4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurl2Q9D0S4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurl2Q9D0S4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurl2Q9D0S4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurl2Q9D0S4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Neurl2Q9D0S4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Neurl2Q9D0S4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurl2Q9D0S4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurl2Q9D0S4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurl2Q9D0S4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurl2Q9D0S4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Neurl2Q9D0S4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Neurl2Q9D0S4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Neurl2Q9D0S4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Neurl2Q9D0S4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurl2Q9D0S4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurl2Q9D0S4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurl2Q9D0S4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurl2Q9D0S4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurl2Q9D0S4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurl2Q9D0S4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurl2Q9D0S4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurl2Q9D0S4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurl2Q9D0S4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurl2Q9D0S4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurl2Q9D0S4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurl2Q9D0S4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurl2Q9D0S4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurl2Q9D0S4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurl2Q9D0S4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurl2Q9D0S4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurl2Q9D0S4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurl2Q9D0S4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurl2Q9D0S4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurl2Q9D0S4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurl2Q9D0S4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Neurl2Q9D0S4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Neurl2Q9D0S4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Neurl2Q9D0S4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurl2Q9D0S4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurl2Q9D0S4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurl2Q9D0S4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Neurl2Q9D0S4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Neurl2Q9D0S4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Neurl2Q9D0S4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Neurl2Q9D0S4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Neurl2Q9D0S4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Neurl2Q9D0S4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Neurl2Q9D0S4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Neurl2Q9D0S4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Neurl2Q9D0S4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Neurl2Q9D0S4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurl2Q9D0S4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurl2Q9D0S4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurl2Q9D0S4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurl2Q9D0S4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Neurl2Q9D0S4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurl2Q9D0S4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurl2Q9D0S4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurl2Q9D0S4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurl2Q9D0S4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurl2Q9D0S4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurl2Q9D0S4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurl2Q9D0S4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurl2Q9D0S4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurl2Q9D0S4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurl2Q9D0S4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurl2Q9D0S4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurl2Q9D0S4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurl2Q9D0S4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Neurl2Q9D0S4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurl2Q9D0S4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurl2Q9D0S4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurl2Q9D0S4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurl2Q9D0S4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurl2Q9D0S4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurl2Q9D0S4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurl2Q9D0S4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurl2Q9D0S4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurl2Q9D0S4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurl2Q9D0S4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurl2Q9D0S4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurl2Q9D0S4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurl2Q9D0S4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurl2Q9D0S4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurl2Q9D0S4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurl2Q9D0S4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurl2Q9D0S4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurl2Q9D0S4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurl2Q9D0S4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms