Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZG3

Commd8, COMM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd8Q9CZG3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Commd8Q9CZG3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Commd8Q9CZG3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Commd8Q9CZG3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Commd8Q9CZG3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Commd8Q9CZG3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Commd8Q9CZG3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Commd8Q9CZG3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Commd8Q9CZG3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Commd8Q9CZG3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Commd8Q9CZG3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Commd8Q9CZG3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Commd8Q9CZG3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Commd8Q9CZG3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Commd8Q9CZG3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Commd8Q9CZG3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Commd8Q9CZG3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Commd8Q9CZG3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Commd8Q9CZG3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Commd8Q9CZG3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Commd8Q9CZG3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Commd8Q9CZG3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Commd8Q9CZG3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Commd8Q9CZG3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Commd8Q9CZG3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Commd8Q9CZG3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Commd8Q9CZG3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Commd8Q9CZG3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Commd8Q9CZG3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Commd8Q9CZG3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Commd8Q9CZG3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Commd8Q9CZG3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Commd8Q9CZG3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Commd8Q9CZG3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Commd8Q9CZG3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Commd8Q9CZG3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Commd8Q9CZG3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Commd8Q9CZG3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Commd8Q9CZG3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Commd8Q9CZG3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Commd8Q9CZG3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Commd8Q9CZG3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Commd8Q9CZG3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Commd8Q9CZG3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Commd8Q9CZG3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Commd8Q9CZG3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Commd8Q9CZG3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Commd8Q9CZG3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Commd8Q9CZG3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Commd8Q9CZG3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Commd8Q9CZG3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Commd8Q9CZG3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Commd8Q9CZG3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Commd8Q9CZG3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Commd8Q9CZG3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Commd8Q9CZG3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Commd8Q9CZG3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Commd8Q9CZG3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Commd8Q9CZG3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Commd8Q9CZG3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Commd8Q9CZG3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Commd8Q9CZG3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Commd8Q9CZG3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Commd8Q9CZG3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Commd8Q9CZG3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Commd8Q9CZG3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Commd8Q9CZG3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Commd8Q9CZG3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Commd8Q9CZG3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Commd8Q9CZG3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Commd8Q9CZG3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Commd8Q9CZG3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Commd8Q9CZG3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Commd8Q9CZG3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Commd8Q9CZG3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Commd8Q9CZG3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Commd8Q9CZG3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Commd8Q9CZG3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Commd8Q9CZG3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Commd8Q9CZG3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Commd8Q9CZG3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Commd8Q9CZG3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Commd8Q9CZG3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Commd8Q9CZG3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Commd8Q9CZG3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Commd8Q9CZG3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Commd8Q9CZG3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Commd8Q9CZG3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Commd8Q9CZG3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Commd8Q9CZG3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Commd8Q9CZG3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Commd8Q9CZG3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Commd8Q9CZG3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Commd8Q9CZG3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Commd8Q9CZG3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Commd8Q9CZG3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Commd8Q9CZG3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Commd8Q9CZG3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Commd8Q9CZG3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Commd8Q9CZG3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms