Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ91

Srfbp1, Serum response factor-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srfbp1Q9CZ91 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srfbp1Q9CZ91 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srfbp1Q9CZ91 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srfbp1Q9CZ91 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srfbp1Q9CZ91 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srfbp1Q9CZ91 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srfbp1Q9CZ91 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srfbp1Q9CZ91 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Srfbp1Q9CZ91 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Srfbp1Q9CZ91 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Srfbp1Q9CZ91 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Srfbp1Q9CZ91 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srfbp1Q9CZ91 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srfbp1Q9CZ91 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srfbp1Q9CZ91 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srfbp1Q9CZ91 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srfbp1Q9CZ91 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srfbp1Q9CZ91 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srfbp1Q9CZ91 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srfbp1Q9CZ91 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srfbp1Q9CZ91 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srfbp1Q9CZ91 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srfbp1Q9CZ91 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srfbp1Q9CZ91 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srfbp1Q9CZ91 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srfbp1Q9CZ91 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srfbp1Q9CZ91 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Srfbp1Q9CZ91 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srfbp1Q9CZ91 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srfbp1Q9CZ91 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srfbp1Q9CZ91 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srfbp1Q9CZ91 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srfbp1Q9CZ91 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srfbp1Q9CZ91 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srfbp1Q9CZ91 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Srfbp1Q9CZ91 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srfbp1Q9CZ91 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srfbp1Q9CZ91 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Srfbp1Q9CZ91 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srfbp1Q9CZ91 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srfbp1Q9CZ91 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srfbp1Q9CZ91 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srfbp1Q9CZ91 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srfbp1Q9CZ91 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srfbp1Q9CZ91 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srfbp1Q9CZ91 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Srfbp1Q9CZ91 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srfbp1Q9CZ91 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srfbp1Q9CZ91 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srfbp1Q9CZ91 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srfbp1Q9CZ91 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srfbp1Q9CZ91 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srfbp1Q9CZ91 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srfbp1Q9CZ91 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srfbp1Q9CZ91 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srfbp1Q9CZ91 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srfbp1Q9CZ91 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srfbp1Q9CZ91 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srfbp1Q9CZ91 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srfbp1Q9CZ91 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srfbp1Q9CZ91 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srfbp1Q9CZ91 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srfbp1Q9CZ91 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Srfbp1Q9CZ91 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Srfbp1Q9CZ91 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srfbp1Q9CZ91 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srfbp1Q9CZ91 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srfbp1Q9CZ91 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srfbp1Q9CZ91 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srfbp1Q9CZ91 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Srfbp1Q9CZ91 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Srfbp1Q9CZ91 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Srfbp1Q9CZ91 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srfbp1Q9CZ91 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srfbp1Q9CZ91 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srfbp1Q9CZ91 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srfbp1Q9CZ91 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srfbp1Q9CZ91 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srfbp1Q9CZ91 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srfbp1Q9CZ91 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srfbp1Q9CZ91 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Srfbp1Q9CZ91 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srfbp1Q9CZ91 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srfbp1Q9CZ91 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srfbp1Q9CZ91 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srfbp1Q9CZ91 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srfbp1Q9CZ91 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srfbp1Q9CZ91 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srfbp1Q9CZ91 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srfbp1Q9CZ91 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srfbp1Q9CZ91 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srfbp1Q9CZ91 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srfbp1Q9CZ91 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srfbp1Q9CZ91 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srfbp1Q9CZ91 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srfbp1Q9CZ91 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srfbp1Q9CZ91 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srfbp1Q9CZ91 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srfbp1Q9CZ91 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srfbp1Q9CZ91 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms