Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Exo5Q9CXP9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Exo5Q9CXP9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Exo5Q9CXP9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Exo5Q9CXP9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Exo5Q9CXP9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Exo5Q9CXP9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Exo5Q9CXP9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Exo5Q9CXP9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Exo5Q9CXP9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Exo5Q9CXP9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Exo5Q9CXP9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Exo5Q9CXP9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Exo5Q9CXP9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Exo5Q9CXP9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Exo5Q9CXP9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Exo5Q9CXP9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Exo5Q9CXP9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Exo5Q9CXP9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Exo5Q9CXP9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Exo5Q9CXP9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Exo5Q9CXP9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Exo5Q9CXP9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Exo5Q9CXP9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Exo5Q9CXP9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Exo5Q9CXP9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Exo5Q9CXP9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Exo5Q9CXP9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Exo5Q9CXP9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Exo5Q9CXP9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Exo5Q9CXP9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Exo5Q9CXP9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Exo5Q9CXP9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Exo5Q9CXP9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Exo5Q9CXP9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Exo5Q9CXP9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Exo5Q9CXP9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Exo5Q9CXP9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Exo5Q9CXP9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Exo5Q9CXP9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Exo5Q9CXP9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Exo5Q9CXP9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Exo5Q9CXP9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Exo5Q9CXP9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Exo5Q9CXP9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Exo5Q9CXP9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Exo5Q9CXP9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Exo5Q9CXP9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Exo5Q9CXP9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Exo5Q9CXP9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Exo5Q9CXP9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Exo5Q9CXP9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Exo5Q9CXP9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Exo5Q9CXP9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Exo5Q9CXP9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Exo5Q9CXP9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Exo5Q9CXP9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Exo5Q9CXP9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Exo5Q9CXP9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Exo5Q9CXP9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Exo5Q9CXP9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Exo5Q9CXP9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Exo5Q9CXP9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Exo5Q9CXP9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Exo5Q9CXP9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Exo5Q9CXP9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Exo5Q9CXP9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Exo5Q9CXP9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Exo5Q9CXP9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Exo5Q9CXP9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Exo5Q9CXP9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Exo5Q9CXP9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Exo5Q9CXP9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Exo5Q9CXP9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Exo5Q9CXP9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Exo5Q9CXP9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Exo5Q9CXP9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Exo5Q9CXP9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Exo5Q9CXP9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Exo5Q9CXP9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Exo5Q9CXP9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Exo5Q9CXP9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Exo5Q9CXP9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Exo5Q9CXP9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Exo5Q9CXP9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Exo5Q9CXP9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Exo5Q9CXP9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Exo5Q9CXP9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Exo5Q9CXP9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Exo5Q9CXP9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Exo5Q9CXP9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Exo5Q9CXP9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Exo5Q9CXP9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Exo5Q9CXP9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Exo5Q9CXP9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Exo5Q9CXP9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Exo5Q9CXP9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Exo5Q9CXP9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Exo5Q9CXP9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Exo5Q9CXP9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms