Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXG9

Phf19, PHD finger protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf19Q9CXG9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf19Q9CXG9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf19Q9CXG9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf19Q9CXG9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf19Q9CXG9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf19Q9CXG9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf19Q9CXG9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf19Q9CXG9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf19Q9CXG9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf19Q9CXG9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf19Q9CXG9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf19Q9CXG9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phf19Q9CXG9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf19Q9CXG9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf19Q9CXG9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phf19Q9CXG9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phf19Q9CXG9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Phf19Q9CXG9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf19Q9CXG9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf19Q9CXG9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf19Q9CXG9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf19Q9CXG9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phf19Q9CXG9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phf19Q9CXG9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf19Q9CXG9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phf19Q9CXG9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf19Q9CXG9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf19Q9CXG9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf19Q9CXG9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf19Q9CXG9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf19Q9CXG9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf19Q9CXG9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf19Q9CXG9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf19Q9CXG9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf19Q9CXG9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf19Q9CXG9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf19Q9CXG9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf19Q9CXG9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf19Q9CXG9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf19Q9CXG9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phf19Q9CXG9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phf19Q9CXG9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phf19Q9CXG9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf19Q9CXG9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf19Q9CXG9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf19Q9CXG9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf19Q9CXG9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf19Q9CXG9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf19Q9CXG9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf19Q9CXG9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phf19Q9CXG9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf19Q9CXG9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf19Q9CXG9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf19Q9CXG9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phf19Q9CXG9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf19Q9CXG9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phf19Q9CXG9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phf19Q9CXG9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf19Q9CXG9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf19Q9CXG9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf19Q9CXG9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf19Q9CXG9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf19Q9CXG9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf19Q9CXG9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf19Q9CXG9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf19Q9CXG9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf19Q9CXG9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf19Q9CXG9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf19Q9CXG9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf19Q9CXG9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Phf19Q9CXG9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Phf19Q9CXG9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Phf19Q9CXG9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phf19Q9CXG9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf19Q9CXG9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf19Q9CXG9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf19Q9CXG9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf19Q9CXG9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Phf19Q9CXG9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phf19Q9CXG9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phf19Q9CXG9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phf19Q9CXG9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phf19Q9CXG9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phf19Q9CXG9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf19Q9CXG9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf19Q9CXG9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf19Q9CXG9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phf19Q9CXG9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Phf19Q9CXG9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf19Q9CXG9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf19Q9CXG9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phf19Q9CXG9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phf19Q9CXG9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phf19Q9CXG9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phf19Q9CXG9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phf19Q9CXG9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phf19Q9CXG9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phf19Q9CXG9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf19Q9CXG9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf19Q9CXG9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms