Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXF7

Chd1l, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1lQ9CXF7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chd1lQ9CXF7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd1lQ9CXF7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd1lQ9CXF7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd1lQ9CXF7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd1lQ9CXF7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chd1lQ9CXF7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chd1lQ9CXF7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chd1lQ9CXF7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chd1lQ9CXF7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chd1lQ9CXF7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chd1lQ9CXF7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Chd1lQ9CXF7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Chd1lQ9CXF7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Chd1lQ9CXF7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chd1lQ9CXF7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chd1lQ9CXF7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chd1lQ9CXF7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd1lQ9CXF7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Chd1lQ9CXF7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chd1lQ9CXF7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd1lQ9CXF7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd1lQ9CXF7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chd1lQ9CXF7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chd1lQ9CXF7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chd1lQ9CXF7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chd1lQ9CXF7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chd1lQ9CXF7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Chd1lQ9CXF7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Chd1lQ9CXF7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd1lQ9CXF7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chd1lQ9CXF7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Chd1lQ9CXF7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chd1lQ9CXF7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chd1lQ9CXF7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chd1lQ9CXF7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chd1lQ9CXF7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd1lQ9CXF7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd1lQ9CXF7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd1lQ9CXF7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd1lQ9CXF7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd1lQ9CXF7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd1lQ9CXF7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd1lQ9CXF7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd1lQ9CXF7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd1lQ9CXF7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd1lQ9CXF7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chd1lQ9CXF7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd1lQ9CXF7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd1lQ9CXF7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chd1lQ9CXF7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chd1lQ9CXF7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chd1lQ9CXF7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chd1lQ9CXF7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chd1lQ9CXF7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chd1lQ9CXF7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chd1lQ9CXF7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chd1lQ9CXF7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chd1lQ9CXF7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Chd1lQ9CXF7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chd1lQ9CXF7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chd1lQ9CXF7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chd1lQ9CXF7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chd1lQ9CXF7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chd1lQ9CXF7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chd1lQ9CXF7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chd1lQ9CXF7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Chd1lQ9CXF7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Chd1lQ9CXF7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chd1lQ9CXF7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chd1lQ9CXF7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chd1lQ9CXF7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chd1lQ9CXF7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chd1lQ9CXF7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chd1lQ9CXF7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chd1lQ9CXF7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chd1lQ9CXF7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chd1lQ9CXF7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chd1lQ9CXF7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chd1lQ9CXF7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chd1lQ9CXF7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chd1lQ9CXF7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chd1lQ9CXF7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chd1lQ9CXF7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Chd1lQ9CXF7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chd1lQ9CXF7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Chd1lQ9CXF7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Chd1lQ9CXF7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chd1lQ9CXF7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Chd1lQ9CXF7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Chd1lQ9CXF7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Chd1lQ9CXF7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chd1lQ9CXF7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chd1lQ9CXF7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd1lQ9CXF7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd1lQ9CXF7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd1lQ9CXF7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd1lQ9CXF7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd1lQ9CXF7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd1lQ9CXF7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms