Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx28Q9CWT6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx28Q9CWT6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx28Q9CWT6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx28Q9CWT6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx28Q9CWT6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx28Q9CWT6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx28Q9CWT6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx28Q9CWT6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx28Q9CWT6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx28Q9CWT6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx28Q9CWT6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx28Q9CWT6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx28Q9CWT6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx28Q9CWT6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx28Q9CWT6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx28Q9CWT6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx28Q9CWT6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx28Q9CWT6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx28Q9CWT6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx28Q9CWT6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx28Q9CWT6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx28Q9CWT6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx28Q9CWT6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx28Q9CWT6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx28Q9CWT6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx28Q9CWT6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx28Q9CWT6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx28Q9CWT6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx28Q9CWT6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx28Q9CWT6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx28Q9CWT6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx28Q9CWT6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx28Q9CWT6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx28Q9CWT6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx28Q9CWT6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx28Q9CWT6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx28Q9CWT6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx28Q9CWT6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx28Q9CWT6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx28Q9CWT6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx28Q9CWT6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx28Q9CWT6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx28Q9CWT6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx28Q9CWT6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx28Q9CWT6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx28Q9CWT6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx28Q9CWT6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx28Q9CWT6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx28Q9CWT6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx28Q9CWT6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx28Q9CWT6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx28Q9CWT6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx28Q9CWT6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx28Q9CWT6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx28Q9CWT6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx28Q9CWT6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx28Q9CWT6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx28Q9CWT6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx28Q9CWT6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx28Q9CWT6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ddx28Q9CWT6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx28Q9CWT6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx28Q9CWT6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx28Q9CWT6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx28Q9CWT6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx28Q9CWT6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx28Q9CWT6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx28Q9CWT6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx28Q9CWT6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx28Q9CWT6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx28Q9CWT6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx28Q9CWT6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx28Q9CWT6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx28Q9CWT6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx28Q9CWT6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx28Q9CWT6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx28Q9CWT6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ddx28Q9CWT6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx28Q9CWT6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx28Q9CWT6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx28Q9CWT6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx28Q9CWT6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx28Q9CWT6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx28Q9CWT6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx28Q9CWT6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx28Q9CWT6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx28Q9CWT6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx28Q9CWT6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx28Q9CWT6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx28Q9CWT6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx28Q9CWT6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx28Q9CWT6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx28Q9CWT6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx28Q9CWT6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddx28Q9CWT6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddx28Q9CWT6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx28Q9CWT6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx28Q9CWT6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms