Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pfdn1Q9CWM4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pfdn1Q9CWM4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pfdn1Q9CWM4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pfdn1Q9CWM4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pfdn1Q9CWM4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pfdn1Q9CWM4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pfdn1Q9CWM4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pfdn1Q9CWM4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pfdn1Q9CWM4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pfdn1Q9CWM4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pfdn1Q9CWM4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pfdn1Q9CWM4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pfdn1Q9CWM4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pfdn1Q9CWM4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pfdn1Q9CWM4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pfdn1Q9CWM4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pfdn1Q9CWM4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pfdn1Q9CWM4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pfdn1Q9CWM4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pfdn1Q9CWM4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pfdn1Q9CWM4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pfdn1Q9CWM4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pfdn1Q9CWM4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pfdn1Q9CWM4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pfdn1Q9CWM4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pfdn1Q9CWM4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pfdn1Q9CWM4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pfdn1Q9CWM4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pfdn1Q9CWM4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pfdn1Q9CWM4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pfdn1Q9CWM4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pfdn1Q9CWM4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfdn1Q9CWM4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfdn1Q9CWM4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfdn1Q9CWM4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfdn1Q9CWM4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfdn1Q9CWM4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfdn1Q9CWM4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfdn1Q9CWM4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pfdn1Q9CWM4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pfdn1Q9CWM4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pfdn1Q9CWM4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pfdn1Q9CWM4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pfdn1Q9CWM4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pfdn1Q9CWM4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pfdn1Q9CWM4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pfdn1Q9CWM4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pfdn1Q9CWM4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfdn1Q9CWM4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pfdn1Q9CWM4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pfdn1Q9CWM4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pfdn1Q9CWM4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pfdn1Q9CWM4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pfdn1Q9CWM4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pfdn1Q9CWM4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pfdn1Q9CWM4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pfdn1Q9CWM4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pfdn1Q9CWM4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pfdn1Q9CWM4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pfdn1Q9CWM4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pfdn1Q9CWM4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pfdn1Q9CWM4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pfdn1Q9CWM4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pfdn1Q9CWM4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pfdn1Q9CWM4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pfdn1Q9CWM4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pfdn1Q9CWM4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pfdn1Q9CWM4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pfdn1Q9CWM4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pfdn1Q9CWM4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pfdn1Q9CWM4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pfdn1Q9CWM4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pfdn1Q9CWM4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pfdn1Q9CWM4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pfdn1Q9CWM4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pfdn1Q9CWM4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pfdn1Q9CWM4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pfdn1Q9CWM4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pfdn1Q9CWM4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pfdn1Q9CWM4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pfdn1Q9CWM4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pfdn1Q9CWM4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pfdn1Q9CWM4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pfdn1Q9CWM4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pfdn1Q9CWM4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pfdn1Q9CWM4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pfdn1Q9CWM4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pfdn1Q9CWM4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pfdn1Q9CWM4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pfdn1Q9CWM4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pfdn1Q9CWM4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pfdn1Q9CWM4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pfdn1Q9CWM4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pfdn1Q9CWM4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pfdn1Q9CWM4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pfdn1Q9CWM4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pfdn1Q9CWM4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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