Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tubb2bQ9CWF2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tubb2bQ9CWF2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tubb2bQ9CWF2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tubb2bQ9CWF2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Tubb2bQ9CWF2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tubb2bQ9CWF2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Tubb2bQ9CWF2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tubb2bQ9CWF2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tubb2bQ9CWF2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tubb2bQ9CWF2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tubb2bQ9CWF2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tubb2bQ9CWF2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tubb2bQ9CWF2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Tubb2bQ9CWF2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tubb2bQ9CWF2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tubb2bQ9CWF2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tubb2bQ9CWF2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tubb2bQ9CWF2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tubb2bQ9CWF2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tubb2bQ9CWF2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tubb2bQ9CWF2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tubb2bQ9CWF2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tubb2bQ9CWF2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tubb2bQ9CWF2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tubb2bQ9CWF2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Tubb2bQ9CWF2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tubb2bQ9CWF2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tubb2bQ9CWF2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tubb2bQ9CWF2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tubb2bQ9CWF2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tubb2bQ9CWF2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tubb2bQ9CWF2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tubb2bQ9CWF2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tubb2bQ9CWF2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tubb2bQ9CWF2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tubb2bQ9CWF2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tubb2bQ9CWF2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubb2bQ9CWF2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubb2bQ9CWF2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubb2bQ9CWF2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tubb2bQ9CWF2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tubb2bQ9CWF2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tubb2bQ9CWF2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tubb2bQ9CWF2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tubb2bQ9CWF2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tubb2bQ9CWF2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tubb2bQ9CWF2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tubb2bQ9CWF2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Tubb2bQ9CWF2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tubb2bQ9CWF2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tubb2bQ9CWF2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tubb2bQ9CWF2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tubb2bQ9CWF2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tubb2bQ9CWF2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tubb2bQ9CWF2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tubb2bQ9CWF2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tubb2bQ9CWF2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubb2bQ9CWF2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubb2bQ9CWF2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Tubb2bQ9CWF2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tubb2bQ9CWF2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tubb2bQ9CWF2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tubb2bQ9CWF2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tubb2bQ9CWF2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tubb2bQ9CWF2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tubb2bQ9CWF2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tubb2bQ9CWF2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubb2bQ9CWF2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubb2bQ9CWF2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubb2bQ9CWF2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Tubb2bQ9CWF2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tubb2bQ9CWF2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tubb2bQ9CWF2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tubb2bQ9CWF2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Tubb2bQ9CWF2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Tubb2bQ9CWF2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tubb2bQ9CWF2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubb2bQ9CWF2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tubb2bQ9CWF2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tubb2bQ9CWF2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tubb2bQ9CWF2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tubb2bQ9CWF2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tubb2bQ9CWF2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tubb2bQ9CWF2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tubb2bQ9CWF2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tubb2bQ9CWF2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubb2bQ9CWF2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubb2bQ9CWF2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubb2bQ9CWF2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tubb2bQ9CWF2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tubb2bQ9CWF2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tubb2bQ9CWF2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tubb2bQ9CWF2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tubb2bQ9CWF2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tubb2bQ9CWF2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tubb2bQ9CWF2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tubb2bQ9CWF2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tubb2bQ9CWF2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tubb2bQ9CWF2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms