Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp13a2Q9CTG6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp13a2Q9CTG6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp13a2Q9CTG6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp13a2Q9CTG6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp13a2Q9CTG6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp13a2Q9CTG6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp13a2Q9CTG6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp13a2Q9CTG6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp13a2Q9CTG6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp13a2Q9CTG6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp13a2Q9CTG6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp13a2Q9CTG6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp13a2Q9CTG6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp13a2Q9CTG6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp13a2Q9CTG6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp13a2Q9CTG6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp13a2Q9CTG6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp13a2Q9CTG6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp13a2Q9CTG6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp13a2Q9CTG6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp13a2Q9CTG6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp13a2Q9CTG6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp13a2Q9CTG6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp13a2Q9CTG6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp13a2Q9CTG6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp13a2Q9CTG6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp13a2Q9CTG6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp13a2Q9CTG6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp13a2Q9CTG6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp13a2Q9CTG6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp13a2Q9CTG6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp13a2Q9CTG6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp13a2Q9CTG6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp13a2Q9CTG6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp13a2Q9CTG6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp13a2Q9CTG6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp13a2Q9CTG6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp13a2Q9CTG6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp13a2Q9CTG6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp13a2Q9CTG6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp13a2Q9CTG6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp13a2Q9CTG6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp13a2Q9CTG6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp13a2Q9CTG6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp13a2Q9CTG6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp13a2Q9CTG6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp13a2Q9CTG6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp13a2Q9CTG6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp13a2Q9CTG6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp13a2Q9CTG6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp13a2Q9CTG6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp13a2Q9CTG6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp13a2Q9CTG6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp13a2Q9CTG6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp13a2Q9CTG6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp13a2Q9CTG6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp13a2Q9CTG6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp13a2Q9CTG6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp13a2Q9CTG6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp13a2Q9CTG6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp13a2Q9CTG6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp13a2Q9CTG6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp13a2Q9CTG6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp13a2Q9CTG6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp13a2Q9CTG6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp13a2Q9CTG6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp13a2Q9CTG6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp13a2Q9CTG6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp13a2Q9CTG6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp13a2Q9CTG6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp13a2Q9CTG6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp13a2Q9CTG6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp13a2Q9CTG6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp13a2Q9CTG6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a2Q9CTG6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a2Q9CTG6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp13a2Q9CTG6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp13a2Q9CTG6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp13a2Q9CTG6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp13a2Q9CTG6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp13a2Q9CTG6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a2Q9CTG6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a2Q9CTG6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a2Q9CTG6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a2Q9CTG6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a2Q9CTG6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a2Q9CTG6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a2Q9CTG6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a2Q9CTG6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a2Q9CTG6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a2Q9CTG6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a2Q9CTG6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a2Q9CTG6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a2Q9CTG6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a2Q9CTG6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a2Q9CTG6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a2Q9CTG6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a2Q9CTG6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a2Q9CTG6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms