Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prps2Q9CS42 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prps2Q9CS42 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prps2Q9CS42 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prps2Q9CS42 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prps2Q9CS42 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prps2Q9CS42 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Prps2Q9CS42 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prps2Q9CS42 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prps2Q9CS42 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prps2Q9CS42 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prps2Q9CS42 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prps2Q9CS42 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prps2Q9CS42 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prps2Q9CS42 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prps2Q9CS42 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prps2Q9CS42 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prps2Q9CS42 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prps2Q9CS42 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Prps2Q9CS42 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prps2Q9CS42 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prps2Q9CS42 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prps2Q9CS42 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prps2Q9CS42 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prps2Q9CS42 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prps2Q9CS42 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prps2Q9CS42 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prps2Q9CS42 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prps2Q9CS42 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prps2Q9CS42 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Prps2Q9CS42 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prps2Q9CS42 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Prps2Q9CS42 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prps2Q9CS42 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prps2Q9CS42 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prps2Q9CS42 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prps2Q9CS42 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prps2Q9CS42 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prps2Q9CS42 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prps2Q9CS42 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prps2Q9CS42 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prps2Q9CS42 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prps2Q9CS42 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prps2Q9CS42 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prps2Q9CS42 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prps2Q9CS42 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prps2Q9CS42 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prps2Q9CS42 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prps2Q9CS42 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prps2Q9CS42 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prps2Q9CS42 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prps2Q9CS42 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prps2Q9CS42 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prps2Q9CS42 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prps2Q9CS42 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prps2Q9CS42 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prps2Q9CS42 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prps2Q9CS42 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prps2Q9CS42 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prps2Q9CS42 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prps2Q9CS42 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prps2Q9CS42 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prps2Q9CS42 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prps2Q9CS42 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prps2Q9CS42 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prps2Q9CS42 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prps2Q9CS42 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prps2Q9CS42 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prps2Q9CS42 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prps2Q9CS42 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prps2Q9CS42 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prps2Q9CS42 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prps2Q9CS42 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prps2Q9CS42 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prps2Q9CS42 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prps2Q9CS42 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prps2Q9CS42 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prps2Q9CS42 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prps2Q9CS42 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prps2Q9CS42 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prps2Q9CS42 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prps2Q9CS42 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prps2Q9CS42 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prps2Q9CS42 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prps2Q9CS42 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prps2Q9CS42 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prps2Q9CS42 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prps2Q9CS42 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prps2Q9CS42 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prps2Q9CS42 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prps2Q9CS42 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prps2Q9CS42 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prps2Q9CS42 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prps2Q9CS42 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prps2Q9CS42 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prps2Q9CS42 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prps2Q9CS42 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prps2Q9CS42 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prps2Q9CS42 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prps2Q9CS42 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms