Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp5sQ9CRA7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp5sQ9CRA7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp5sQ9CRA7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp5sQ9CRA7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp5sQ9CRA7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp5sQ9CRA7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp5sQ9CRA7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp5sQ9CRA7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp5sQ9CRA7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp5sQ9CRA7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp5sQ9CRA7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp5sQ9CRA7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp5sQ9CRA7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp5sQ9CRA7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp5sQ9CRA7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp5sQ9CRA7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp5sQ9CRA7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp5sQ9CRA7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp5sQ9CRA7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp5sQ9CRA7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp5sQ9CRA7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp5sQ9CRA7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp5sQ9CRA7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp5sQ9CRA7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp5sQ9CRA7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp5sQ9CRA7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp5sQ9CRA7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp5sQ9CRA7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp5sQ9CRA7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp5sQ9CRA7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp5sQ9CRA7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp5sQ9CRA7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp5sQ9CRA7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp5sQ9CRA7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp5sQ9CRA7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp5sQ9CRA7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp5sQ9CRA7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp5sQ9CRA7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp5sQ9CRA7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp5sQ9CRA7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp5sQ9CRA7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp5sQ9CRA7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp5sQ9CRA7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp5sQ9CRA7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp5sQ9CRA7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp5sQ9CRA7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp5sQ9CRA7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp5sQ9CRA7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp5sQ9CRA7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp5sQ9CRA7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp5sQ9CRA7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp5sQ9CRA7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp5sQ9CRA7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp5sQ9CRA7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp5sQ9CRA7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp5sQ9CRA7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp5sQ9CRA7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp5sQ9CRA7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp5sQ9CRA7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp5sQ9CRA7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp5sQ9CRA7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp5sQ9CRA7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp5sQ9CRA7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp5sQ9CRA7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp5sQ9CRA7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp5sQ9CRA7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp5sQ9CRA7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atp5sQ9CRA7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp5sQ9CRA7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp5sQ9CRA7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp5sQ9CRA7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp5sQ9CRA7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp5sQ9CRA7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp5sQ9CRA7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp5sQ9CRA7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp5sQ9CRA7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp5sQ9CRA7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp5sQ9CRA7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp5sQ9CRA7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp5sQ9CRA7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp5sQ9CRA7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp5sQ9CRA7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp5sQ9CRA7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp5sQ9CRA7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp5sQ9CRA7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp5sQ9CRA7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp5sQ9CRA7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp5sQ9CRA7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp5sQ9CRA7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atp5sQ9CRA7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atp5sQ9CRA7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atp5sQ9CRA7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp5sQ9CRA7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp5sQ9CRA7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp5sQ9CRA7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp5sQ9CRA7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp5sQ9CRA7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp5sQ9CRA7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp5sQ9CRA7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms