Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Nicn1Q9CQM0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nicn1Q9CQM0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nicn1Q9CQM0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nicn1Q9CQM0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nicn1Q9CQM0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nicn1Q9CQM0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nicn1Q9CQM0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Nicn1Q9CQM0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nicn1Q9CQM0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nicn1Q9CQM0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nicn1Q9CQM0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nicn1Q9CQM0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nicn1Q9CQM0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Nicn1Q9CQM0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nicn1Q9CQM0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nicn1Q9CQM0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nicn1Q9CQM0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nicn1Q9CQM0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nicn1Q9CQM0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nicn1Q9CQM0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nicn1Q9CQM0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nicn1Q9CQM0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nicn1Q9CQM0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nicn1Q9CQM0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nicn1Q9CQM0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nicn1Q9CQM0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nicn1Q9CQM0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nicn1Q9CQM0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nicn1Q9CQM0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nicn1Q9CQM0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nicn1Q9CQM0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nicn1Q9CQM0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nicn1Q9CQM0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nicn1Q9CQM0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nicn1Q9CQM0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nicn1Q9CQM0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nicn1Q9CQM0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nicn1Q9CQM0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nicn1Q9CQM0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nicn1Q9CQM0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nicn1Q9CQM0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nicn1Q9CQM0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Nicn1Q9CQM0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nicn1Q9CQM0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nicn1Q9CQM0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nicn1Q9CQM0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nicn1Q9CQM0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nicn1Q9CQM0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nicn1Q9CQM0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nicn1Q9CQM0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nicn1Q9CQM0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nicn1Q9CQM0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nicn1Q9CQM0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nicn1Q9CQM0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nicn1Q9CQM0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nicn1Q9CQM0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nicn1Q9CQM0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nicn1Q9CQM0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nicn1Q9CQM0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nicn1Q9CQM0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nicn1Q9CQM0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nicn1Q9CQM0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nicn1Q9CQM0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nicn1Q9CQM0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nicn1Q9CQM0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nicn1Q9CQM0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nicn1Q9CQM0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nicn1Q9CQM0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nicn1Q9CQM0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nicn1Q9CQM0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nicn1Q9CQM0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nicn1Q9CQM0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nicn1Q9CQM0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nicn1Q9CQM0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nicn1Q9CQM0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nicn1Q9CQM0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nicn1Q9CQM0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nicn1Q9CQM0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nicn1Q9CQM0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nicn1Q9CQM0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nicn1Q9CQM0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nicn1Q9CQM0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nicn1Q9CQM0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Nicn1Q9CQM0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nicn1Q9CQM0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Nicn1Q9CQM0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nicn1Q9CQM0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nicn1Q9CQM0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nicn1Q9CQM0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nicn1Q9CQM0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nicn1Q9CQM0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nicn1Q9CQM0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nicn1Q9CQM0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nicn1Q9CQM0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms