Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ79

Txndc9, Thioredoxin domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc9Q9CQ79 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Txndc9Q9CQ79 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Txndc9Q9CQ79 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Txndc9Q9CQ79 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Txndc9Q9CQ79 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Txndc9Q9CQ79 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Txndc9Q9CQ79 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Txndc9Q9CQ79 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Txndc9Q9CQ79 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Txndc9Q9CQ79 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Txndc9Q9CQ79 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Txndc9Q9CQ79 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Txndc9Q9CQ79 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Txndc9Q9CQ79 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Txndc9Q9CQ79 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Txndc9Q9CQ79 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Txndc9Q9CQ79 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Txndc9Q9CQ79 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Txndc9Q9CQ79 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Txndc9Q9CQ79 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Txndc9Q9CQ79 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Txndc9Q9CQ79 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Txndc9Q9CQ79 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Txndc9Q9CQ79 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Txndc9Q9CQ79 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Txndc9Q9CQ79 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Txndc9Q9CQ79 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Txndc9Q9CQ79 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Txndc9Q9CQ79 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Txndc9Q9CQ79 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Txndc9Q9CQ79 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Txndc9Q9CQ79 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Txndc9Q9CQ79 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Txndc9Q9CQ79 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Txndc9Q9CQ79 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Txndc9Q9CQ79 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Txndc9Q9CQ79 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Txndc9Q9CQ79 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Txndc9Q9CQ79 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Txndc9Q9CQ79 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Txndc9Q9CQ79 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Txndc9Q9CQ79 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Txndc9Q9CQ79 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Txndc9Q9CQ79 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Txndc9Q9CQ79 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Txndc9Q9CQ79 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Txndc9Q9CQ79 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Txndc9Q9CQ79 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Txndc9Q9CQ79 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Txndc9Q9CQ79 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Txndc9Q9CQ79 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Txndc9Q9CQ79 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Txndc9Q9CQ79 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Txndc9Q9CQ79 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Txndc9Q9CQ79 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Txndc9Q9CQ79 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Txndc9Q9CQ79 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Txndc9Q9CQ79 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Txndc9Q9CQ79 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Txndc9Q9CQ79 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Txndc9Q9CQ79 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Txndc9Q9CQ79 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Txndc9Q9CQ79 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Txndc9Q9CQ79 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Txndc9Q9CQ79 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Txndc9Q9CQ79 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Txndc9Q9CQ79 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Txndc9Q9CQ79 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Txndc9Q9CQ79 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Txndc9Q9CQ79 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Txndc9Q9CQ79 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Txndc9Q9CQ79 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Txndc9Q9CQ79 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Txndc9Q9CQ79 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Txndc9Q9CQ79 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Txndc9Q9CQ79 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Txndc9Q9CQ79 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Txndc9Q9CQ79 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Txndc9Q9CQ79 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Txndc9Q9CQ79 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Txndc9Q9CQ79 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Txndc9Q9CQ79 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Txndc9Q9CQ79 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Txndc9Q9CQ79 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Txndc9Q9CQ79 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Txndc9Q9CQ79 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Txndc9Q9CQ79 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Txndc9Q9CQ79 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Txndc9Q9CQ79 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Txndc9Q9CQ79 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Txndc9Q9CQ79 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Txndc9Q9CQ79 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Txndc9Q9CQ79 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Txndc9Q9CQ79 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Txndc9Q9CQ79 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Txndc9Q9CQ79 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Txndc9Q9CQ79 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Txndc9Q9CQ79 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Txndc9Q9CQ79 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Txndc9Q9CQ79 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.1 ms