Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Use1Q9CQ56 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Use1Q9CQ56 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Use1Q9CQ56 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Use1Q9CQ56 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Use1Q9CQ56 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Use1Q9CQ56 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Use1Q9CQ56 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Use1Q9CQ56 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Use1Q9CQ56 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Use1Q9CQ56 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Use1Q9CQ56 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Use1Q9CQ56 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Use1Q9CQ56 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Use1Q9CQ56 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Use1Q9CQ56 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Use1Q9CQ56 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Use1Q9CQ56 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Use1Q9CQ56 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Use1Q9CQ56 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Use1Q9CQ56 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Use1Q9CQ56 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Use1Q9CQ56 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Use1Q9CQ56 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Use1Q9CQ56 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Use1Q9CQ56 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Use1Q9CQ56 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Use1Q9CQ56 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Use1Q9CQ56 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Use1Q9CQ56 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Use1Q9CQ56 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Use1Q9CQ56 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Use1Q9CQ56 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Use1Q9CQ56 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Use1Q9CQ56 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Use1Q9CQ56 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Use1Q9CQ56 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Use1Q9CQ56 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Use1Q9CQ56 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Use1Q9CQ56 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Use1Q9CQ56 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Use1Q9CQ56 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Use1Q9CQ56 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Use1Q9CQ56 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Use1Q9CQ56 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Use1Q9CQ56 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Use1Q9CQ56 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Use1Q9CQ56 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Use1Q9CQ56 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Use1Q9CQ56 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Use1Q9CQ56 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Use1Q9CQ56 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Use1Q9CQ56 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Use1Q9CQ56 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Use1Q9CQ56 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Use1Q9CQ56 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Use1Q9CQ56 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Use1Q9CQ56 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Use1Q9CQ56 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Use1Q9CQ56 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Use1Q9CQ56 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Use1Q9CQ56 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Use1Q9CQ56 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Use1Q9CQ56 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Use1Q9CQ56 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Use1Q9CQ56 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Use1Q9CQ56 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Use1Q9CQ56 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Use1Q9CQ56 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Use1Q9CQ56 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Use1Q9CQ56 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Use1Q9CQ56 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Use1Q9CQ56 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Use1Q9CQ56 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Use1Q9CQ56 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Use1Q9CQ56 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Use1Q9CQ56 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Use1Q9CQ56 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Use1Q9CQ56 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Use1Q9CQ56 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Use1Q9CQ56 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Use1Q9CQ56 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Use1Q9CQ56 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Use1Q9CQ56 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Use1Q9CQ56 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Use1Q9CQ56 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Use1Q9CQ56 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Use1Q9CQ56 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Use1Q9CQ56 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Use1Q9CQ56 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Use1Q9CQ56 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Use1Q9CQ56 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Use1Q9CQ56 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Use1Q9CQ56 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Use1Q9CQ56 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Use1Q9CQ56 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Use1Q9CQ56 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Use1Q9CQ56 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Use1Q9CQ56 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Use1Q9CQ56 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms