Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
StambpQ9CQ26 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
StambpQ9CQ26 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
StambpQ9CQ26 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
StambpQ9CQ26 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
StambpQ9CQ26 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
StambpQ9CQ26 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
StambpQ9CQ26 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
StambpQ9CQ26 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
StambpQ9CQ26 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
StambpQ9CQ26 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
StambpQ9CQ26 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
StambpQ9CQ26 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
StambpQ9CQ26 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
StambpQ9CQ26 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
StambpQ9CQ26 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
StambpQ9CQ26 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
StambpQ9CQ26 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
StambpQ9CQ26 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
StambpQ9CQ26 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
StambpQ9CQ26 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
StambpQ9CQ26 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
StambpQ9CQ26 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
StambpQ9CQ26 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
StambpQ9CQ26 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
StambpQ9CQ26 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
StambpQ9CQ26 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
StambpQ9CQ26 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
StambpQ9CQ26 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
StambpQ9CQ26 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
StambpQ9CQ26 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms