Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cox6cQ9CPQ1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cox6cQ9CPQ1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cox6cQ9CPQ1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cox6cQ9CPQ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cox6cQ9CPQ1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cox6cQ9CPQ1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cox6cQ9CPQ1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cox6cQ9CPQ1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cox6cQ9CPQ1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cox6cQ9CPQ1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cox6cQ9CPQ1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cox6cQ9CPQ1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cox6cQ9CPQ1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cox6cQ9CPQ1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cox6cQ9CPQ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cox6cQ9CPQ1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cox6cQ9CPQ1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox6cQ9CPQ1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox6cQ9CPQ1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox6cQ9CPQ1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms