Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gtf2a1Q99PM3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gtf2a1Q99PM3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gtf2a1Q99PM3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gtf2a1Q99PM3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gtf2a1Q99PM3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gtf2a1Q99PM3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gtf2a1Q99PM3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gtf2a1Q99PM3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gtf2a1Q99PM3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gtf2a1Q99PM3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gtf2a1Q99PM3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gtf2a1Q99PM3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Gtf2a1Q99PM3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gtf2a1Q99PM3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gtf2a1Q99PM3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gtf2a1Q99PM3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gtf2a1Q99PM3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gtf2a1Q99PM3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gtf2a1Q99PM3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf2a1Q99PM3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf2a1Q99PM3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf2a1Q99PM3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf2a1Q99PM3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtf2a1Q99PM3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtf2a1Q99PM3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gtf2a1Q99PM3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gtf2a1Q99PM3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gtf2a1Q99PM3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gtf2a1Q99PM3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gtf2a1Q99PM3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Gtf2a1Q99PM3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Gtf2a1Q99PM3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gtf2a1Q99PM3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gtf2a1Q99PM3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gtf2a1Q99PM3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtf2a1Q99PM3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtf2a1Q99PM3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtf2a1Q99PM3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gtf2a1Q99PM3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Gtf2a1Q99PM3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gtf2a1Q99PM3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtf2a1Q99PM3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtf2a1Q99PM3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtf2a1Q99PM3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gtf2a1Q99PM3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gtf2a1Q99PM3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gtf2a1Q99PM3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gtf2a1Q99PM3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtf2a1Q99PM3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtf2a1Q99PM3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gtf2a1Q99PM3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gtf2a1Q99PM3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gtf2a1Q99PM3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gtf2a1Q99PM3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gtf2a1Q99PM3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gtf2a1Q99PM3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gtf2a1Q99PM3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gtf2a1Q99PM3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gtf2a1Q99PM3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gtf2a1Q99PM3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gtf2a1Q99PM3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gtf2a1Q99PM3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gtf2a1Q99PM3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gtf2a1Q99PM3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gtf2a1Q99PM3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gtf2a1Q99PM3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtf2a1Q99PM3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtf2a1Q99PM3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtf2a1Q99PM3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtf2a1Q99PM3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtf2a1Q99PM3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Gtf2a1Q99PM3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtf2a1Q99PM3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtf2a1Q99PM3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtf2a1Q99PM3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtf2a1Q99PM3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtf2a1Q99PM3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtf2a1Q99PM3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gtf2a1Q99PM3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtf2a1Q99PM3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtf2a1Q99PM3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtf2a1Q99PM3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtf2a1Q99PM3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gtf2a1Q99PM3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gtf2a1Q99PM3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Gtf2a1Q99PM3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gtf2a1Q99PM3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gtf2a1Q99PM3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gtf2a1Q99PM3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gtf2a1Q99PM3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gtf2a1Q99PM3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gtf2a1Q99PM3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtf2a1Q99PM3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtf2a1Q99PM3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtf2a1Q99PM3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtf2a1Q99PM3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gtf2a1Q99PM3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms