Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc4Q99PH1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc4Q99PH1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc4Q99PH1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc4Q99PH1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc4Q99PH1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc4Q99PH1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc4Q99PH1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc4Q99PH1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc4Q99PH1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc4Q99PH1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc4Q99PH1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc4Q99PH1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc4Q99PH1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc4Q99PH1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc4Q99PH1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc4Q99PH1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc4Q99PH1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc4Q99PH1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc4Q99PH1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc4Q99PH1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc4Q99PH1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc4Q99PH1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc4Q99PH1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc4Q99PH1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc4Q99PH1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc4Q99PH1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc4Q99PH1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc4Q99PH1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc4Q99PH1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc4Q99PH1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc4Q99PH1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc4Q99PH1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc4Q99PH1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc4Q99PH1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc4Q99PH1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc4Q99PH1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc4Q99PH1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc4Q99PH1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc4Q99PH1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc4Q99PH1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc4Q99PH1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc4Q99PH1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc4Q99PH1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc4Q99PH1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc4Q99PH1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc4Q99PH1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc4Q99PH1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc4Q99PH1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc4Q99PH1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc4Q99PH1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc4Q99PH1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc4Q99PH1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc4Q99PH1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc4Q99PH1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc4Q99PH1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc4Q99PH1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc4Q99PH1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc4Q99PH1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc4Q99PH1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc4Q99PH1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc4Q99PH1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc4Q99PH1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc4Q99PH1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc4Q99PH1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc4Q99PH1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc4Q99PH1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc4Q99PH1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lrrc4Q99PH1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lrrc4Q99PH1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc4Q99PH1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc4Q99PH1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc4Q99PH1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc4Q99PH1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc4Q99PH1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc4Q99PH1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc4Q99PH1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc4Q99PH1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc4Q99PH1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc4Q99PH1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc4Q99PH1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc4Q99PH1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc4Q99PH1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc4Q99PH1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc4Q99PH1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc4Q99PH1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc4Q99PH1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc4Q99PH1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc4Q99PH1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc4Q99PH1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc4Q99PH1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc4Q99PH1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc4Q99PH1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc4Q99PH1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc4Q99PH1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc4Q99PH1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc4Q99PH1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc4Q99PH1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc4Q99PH1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc4Q99PH1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms