Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep41Q99NF3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep41Q99NF3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep41Q99NF3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cep41Q99NF3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cep41Q99NF3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cep41Q99NF3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cep41Q99NF3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cep41Q99NF3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cep41Q99NF3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep41Q99NF3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep41Q99NF3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep41Q99NF3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cep41Q99NF3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cep41Q99NF3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cep41Q99NF3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cep41Q99NF3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cep41Q99NF3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cep41Q99NF3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cep41Q99NF3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cep41Q99NF3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep41Q99NF3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep41Q99NF3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep41Q99NF3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep41Q99NF3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep41Q99NF3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep41Q99NF3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep41Q99NF3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep41Q99NF3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep41Q99NF3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep41Q99NF3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep41Q99NF3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cep41Q99NF3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cep41Q99NF3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cep41Q99NF3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cep41Q99NF3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep41Q99NF3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep41Q99NF3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep41Q99NF3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep41Q99NF3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cep41Q99NF3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cep41Q99NF3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cep41Q99NF3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cep41Q99NF3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cep41Q99NF3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cep41Q99NF3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cep41Q99NF3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cep41Q99NF3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cep41Q99NF3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cep41Q99NF3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cep41Q99NF3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cep41Q99NF3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cep41Q99NF3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep41Q99NF3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep41Q99NF3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep41Q99NF3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep41Q99NF3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep41Q99NF3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep41Q99NF3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep41Q99NF3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep41Q99NF3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep41Q99NF3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep41Q99NF3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep41Q99NF3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep41Q99NF3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cep41Q99NF3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep41Q99NF3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep41Q99NF3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep41Q99NF3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep41Q99NF3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep41Q99NF3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep41Q99NF3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep41Q99NF3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep41Q99NF3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep41Q99NF3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep41Q99NF3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep41Q99NF3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep41Q99NF3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep41Q99NF3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep41Q99NF3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep41Q99NF3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep41Q99NF3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep41Q99NF3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep41Q99NF3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep41Q99NF3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep41Q99NF3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep41Q99NF3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep41Q99NF3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep41Q99NF3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep41Q99NF3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep41Q99NF3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep41Q99NF3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep41Q99NF3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep41Q99NF3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep41Q99NF3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep41Q99NF3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep41Q99NF3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep41Q99NF3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cep41Q99NF3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cep41Q99NF3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms