Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lactb2Q99KR3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lactb2Q99KR3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lactb2Q99KR3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lactb2Q99KR3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lactb2Q99KR3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lactb2Q99KR3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lactb2Q99KR3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lactb2Q99KR3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lactb2Q99KR3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lactb2Q99KR3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lactb2Q99KR3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lactb2Q99KR3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lactb2Q99KR3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lactb2Q99KR3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lactb2Q99KR3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lactb2Q99KR3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lactb2Q99KR3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lactb2Q99KR3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lactb2Q99KR3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lactb2Q99KR3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lactb2Q99KR3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lactb2Q99KR3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lactb2Q99KR3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lactb2Q99KR3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lactb2Q99KR3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lactb2Q99KR3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lactb2Q99KR3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lactb2Q99KR3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lactb2Q99KR3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lactb2Q99KR3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lactb2Q99KR3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lactb2Q99KR3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lactb2Q99KR3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lactb2Q99KR3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lactb2Q99KR3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lactb2Q99KR3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lactb2Q99KR3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lactb2Q99KR3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lactb2Q99KR3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lactb2Q99KR3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lactb2Q99KR3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lactb2Q99KR3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lactb2Q99KR3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lactb2Q99KR3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lactb2Q99KR3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lactb2Q99KR3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lactb2Q99KR3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lactb2Q99KR3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lactb2Q99KR3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lactb2Q99KR3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lactb2Q99KR3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lactb2Q99KR3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lactb2Q99KR3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lactb2Q99KR3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lactb2Q99KR3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lactb2Q99KR3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lactb2Q99KR3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lactb2Q99KR3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lactb2Q99KR3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lactb2Q99KR3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lactb2Q99KR3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lactb2Q99KR3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lactb2Q99KR3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lactb2Q99KR3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lactb2Q99KR3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lactb2Q99KR3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lactb2Q99KR3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lactb2Q99KR3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lactb2Q99KR3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lactb2Q99KR3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lactb2Q99KR3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lactb2Q99KR3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lactb2Q99KR3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lactb2Q99KR3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lactb2Q99KR3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lactb2Q99KR3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lactb2Q99KR3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lactb2Q99KR3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lactb2Q99KR3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lactb2Q99KR3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lactb2Q99KR3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lactb2Q99KR3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lactb2Q99KR3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lactb2Q99KR3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lactb2Q99KR3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lactb2Q99KR3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lactb2Q99KR3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lactb2Q99KR3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lactb2Q99KR3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lactb2Q99KR3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lactb2Q99KR3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Lactb2Q99KR3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lactb2Q99KR3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lactb2Q99KR3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lactb2Q99KR3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lactb2Q99KR3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lactb2Q99KR3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lactb2Q99KR3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lactb2Q99KR3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms