Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf19Q99KP6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf19Q99KP6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf19Q99KP6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf19Q99KP6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf19Q99KP6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf19Q99KP6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpf19Q99KP6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf19Q99KP6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf19Q99KP6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf19Q99KP6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf19Q99KP6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf19Q99KP6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf19Q99KP6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf19Q99KP6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf19Q99KP6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prpf19Q99KP6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf19Q99KP6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf19Q99KP6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf19Q99KP6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf19Q99KP6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf19Q99KP6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf19Q99KP6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf19Q99KP6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf19Q99KP6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf19Q99KP6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf19Q99KP6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf19Q99KP6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf19Q99KP6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prpf19Q99KP6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prpf19Q99KP6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prpf19Q99KP6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf19Q99KP6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf19Q99KP6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf19Q99KP6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf19Q99KP6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf19Q99KP6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf19Q99KP6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf19Q99KP6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf19Q99KP6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf19Q99KP6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf19Q99KP6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf19Q99KP6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf19Q99KP6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf19Q99KP6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf19Q99KP6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf19Q99KP6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prpf19Q99KP6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prpf19Q99KP6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf19Q99KP6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf19Q99KP6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf19Q99KP6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf19Q99KP6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf19Q99KP6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf19Q99KP6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf19Q99KP6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf19Q99KP6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf19Q99KP6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf19Q99KP6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf19Q99KP6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf19Q99KP6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf19Q99KP6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf19Q99KP6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf19Q99KP6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf19Q99KP6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf19Q99KP6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf19Q99KP6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf19Q99KP6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf19Q99KP6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf19Q99KP6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf19Q99KP6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf19Q99KP6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf19Q99KP6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf19Q99KP6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf19Q99KP6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf19Q99KP6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf19Q99KP6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf19Q99KP6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf19Q99KP6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf19Q99KP6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf19Q99KP6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf19Q99KP6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf19Q99KP6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf19Q99KP6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf19Q99KP6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf19Q99KP6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf19Q99KP6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf19Q99KP6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf19Q99KP6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf19Q99KP6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf19Q99KP6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf19Q99KP6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf19Q99KP6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf19Q99KP6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf19Q99KP6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prpf19Q99KP6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf19Q99KP6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf19Q99KP6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf19Q99KP6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf19Q99KP6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms