Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Emc3Q99KI3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Emc3Q99KI3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Emc3Q99KI3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Emc3Q99KI3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Emc3Q99KI3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Emc3Q99KI3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Emc3Q99KI3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Emc3Q99KI3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Emc3Q99KI3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Emc3Q99KI3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Emc3Q99KI3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Emc3Q99KI3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Emc3Q99KI3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Emc3Q99KI3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Emc3Q99KI3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Emc3Q99KI3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Emc3Q99KI3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Emc3Q99KI3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Emc3Q99KI3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Emc3Q99KI3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Emc3Q99KI3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Emc3Q99KI3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Emc3Q99KI3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Emc3Q99KI3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Emc3Q99KI3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Emc3Q99KI3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Emc3Q99KI3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Emc3Q99KI3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Emc3Q99KI3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Emc3Q99KI3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Emc3Q99KI3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Emc3Q99KI3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Emc3Q99KI3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Emc3Q99KI3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Emc3Q99KI3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Emc3Q99KI3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Emc3Q99KI3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Emc3Q99KI3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Emc3Q99KI3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Emc3Q99KI3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Emc3Q99KI3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Emc3Q99KI3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emc3Q99KI3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emc3Q99KI3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Emc3Q99KI3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Emc3Q99KI3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Emc3Q99KI3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Emc3Q99KI3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Emc3Q99KI3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Emc3Q99KI3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Emc3Q99KI3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Emc3Q99KI3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Emc3Q99KI3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Emc3Q99KI3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Emc3Q99KI3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Emc3Q99KI3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Emc3Q99KI3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Emc3Q99KI3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Emc3Q99KI3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Emc3Q99KI3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Emc3Q99KI3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Emc3Q99KI3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Emc3Q99KI3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Emc3Q99KI3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Emc3Q99KI3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Emc3Q99KI3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Emc3Q99KI3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Emc3Q99KI3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Emc3Q99KI3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Emc3Q99KI3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Emc3Q99KI3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Emc3Q99KI3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Emc3Q99KI3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Emc3Q99KI3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Emc3Q99KI3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Emc3Q99KI3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Emc3Q99KI3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Emc3Q99KI3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Emc3Q99KI3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Emc3Q99KI3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Emc3Q99KI3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Emc3Q99KI3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Emc3Q99KI3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Emc3Q99KI3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Emc3Q99KI3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Emc3Q99KI3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Emc3Q99KI3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Emc3Q99KI3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Emc3Q99KI3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Emc3Q99KI3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Emc3Q99KI3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Emc3Q99KI3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Emc3Q99KI3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Emc3Q99KI3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Emc3Q99KI3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Emc3Q99KI3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Emc3Q99KI3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Emc3Q99KI3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Emc3Q99KI3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms