Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tlcd1Q99JT6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tlcd1Q99JT6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tlcd1Q99JT6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tlcd1Q99JT6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tlcd1Q99JT6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tlcd1Q99JT6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tlcd1Q99JT6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tlcd1Q99JT6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tlcd1Q99JT6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tlcd1Q99JT6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tlcd1Q99JT6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tlcd1Q99JT6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Tlcd1Q99JT6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tlcd1Q99JT6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tlcd1Q99JT6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tlcd1Q99JT6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tlcd1Q99JT6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tlcd1Q99JT6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tlcd1Q99JT6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Tlcd1Q99JT6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tlcd1Q99JT6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tlcd1Q99JT6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tlcd1Q99JT6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tlcd1Q99JT6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tlcd1Q99JT6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tlcd1Q99JT6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tlcd1Q99JT6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tlcd1Q99JT6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Tlcd1Q99JT6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tlcd1Q99JT6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tlcd1Q99JT6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tlcd1Q99JT6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tlcd1Q99JT6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tlcd1Q99JT6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tlcd1Q99JT6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tlcd1Q99JT6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tlcd1Q99JT6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tlcd1Q99JT6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tlcd1Q99JT6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Tlcd1Q99JT6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tlcd1Q99JT6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tlcd1Q99JT6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tlcd1Q99JT6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tlcd1Q99JT6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tlcd1Q99JT6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Tlcd1Q99JT6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tlcd1Q99JT6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tlcd1Q99JT6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tlcd1Q99JT6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tlcd1Q99JT6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tlcd1Q99JT6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tlcd1Q99JT6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tlcd1Q99JT6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tlcd1Q99JT6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tlcd1Q99JT6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tlcd1Q99JT6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tlcd1Q99JT6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tlcd1Q99JT6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tlcd1Q99JT6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tlcd1Q99JT6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tlcd1Q99JT6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tlcd1Q99JT6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tlcd1Q99JT6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tlcd1Q99JT6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tlcd1Q99JT6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tlcd1Q99JT6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tlcd1Q99JT6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tlcd1Q99JT6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tlcd1Q99JT6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tlcd1Q99JT6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tlcd1Q99JT6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tlcd1Q99JT6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tlcd1Q99JT6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tlcd1Q99JT6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tlcd1Q99JT6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tlcd1Q99JT6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tlcd1Q99JT6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tlcd1Q99JT6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tlcd1Q99JT6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tlcd1Q99JT6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tlcd1Q99JT6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tlcd1Q99JT6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tlcd1Q99JT6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tlcd1Q99JT6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tlcd1Q99JT6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tlcd1Q99JT6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Tlcd1Q99JT6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tlcd1Q99JT6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tlcd1Q99JT6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tlcd1Q99JT6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Tlcd1Q99JT6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tlcd1Q99JT6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tlcd1Q99JT6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tlcd1Q99JT6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tlcd1Q99JT6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tlcd1Q99JT6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tlcd1Q99JT6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tlcd1Q99JT6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tlcd1Q99JT6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms