Protein–RNA interactions for Protein: Q99J45

Nrbp1, Nuclear receptor-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbp1Q99J45 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nrbp1Q99J45 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nrbp1Q99J45 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nrbp1Q99J45 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nrbp1Q99J45 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nrbp1Q99J45 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nrbp1Q99J45 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nrbp1Q99J45 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nrbp1Q99J45 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nrbp1Q99J45 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nrbp1Q99J45 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nrbp1Q99J45 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nrbp1Q99J45 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Nrbp1Q99J45 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nrbp1Q99J45 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nrbp1Q99J45 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nrbp1Q99J45 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nrbp1Q99J45 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nrbp1Q99J45 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nrbp1Q99J45 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nrbp1Q99J45 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Nrbp1Q99J45 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nrbp1Q99J45 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nrbp1Q99J45 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nrbp1Q99J45 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nrbp1Q99J45 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nrbp1Q99J45 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nrbp1Q99J45 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nrbp1Q99J45 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nrbp1Q99J45 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nrbp1Q99J45 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nrbp1Q99J45 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nrbp1Q99J45 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nrbp1Q99J45 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nrbp1Q99J45 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nrbp1Q99J45 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nrbp1Q99J45 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nrbp1Q99J45 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nrbp1Q99J45 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nrbp1Q99J45 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nrbp1Q99J45 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nrbp1Q99J45 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Nrbp1Q99J45 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Nrbp1Q99J45 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nrbp1Q99J45 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nrbp1Q99J45 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nrbp1Q99J45 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nrbp1Q99J45 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nrbp1Q99J45 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nrbp1Q99J45 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Nrbp1Q99J45 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Nrbp1Q99J45 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nrbp1Q99J45 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nrbp1Q99J45 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nrbp1Q99J45 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nrbp1Q99J45 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nrbp1Q99J45 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nrbp1Q99J45 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nrbp1Q99J45 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nrbp1Q99J45 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nrbp1Q99J45 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nrbp1Q99J45 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nrbp1Q99J45 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nrbp1Q99J45 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms