Protein–RNA interactions for Protein: Q99J45

Nrbp1, Nuclear receptor-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbp1Q99J45 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nrbp1Q99J45 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nrbp1Q99J45 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nrbp1Q99J45 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nrbp1Q99J45 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nrbp1Q99J45 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nrbp1Q99J45 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nrbp1Q99J45 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nrbp1Q99J45 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nrbp1Q99J45 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nrbp1Q99J45 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nrbp1Q99J45 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nrbp1Q99J45 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Nrbp1Q99J45 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nrbp1Q99J45 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nrbp1Q99J45 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nrbp1Q99J45 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nrbp1Q99J45 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nrbp1Q99J45 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nrbp1Q99J45 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nrbp1Q99J45 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Nrbp1Q99J45 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nrbp1Q99J45 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nrbp1Q99J45 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nrbp1Q99J45 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nrbp1Q99J45 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nrbp1Q99J45 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nrbp1Q99J45 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nrbp1Q99J45 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nrbp1Q99J45 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nrbp1Q99J45 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nrbp1Q99J45 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nrbp1Q99J45 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nrbp1Q99J45 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nrbp1Q99J45 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nrbp1Q99J45 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nrbp1Q99J45 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nrbp1Q99J45 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nrbp1Q99J45 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nrbp1Q99J45 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nrbp1Q99J45 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nrbp1Q99J45 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nrbp1Q99J45 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Nrbp1Q99J45 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Nrbp1Q99J45 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nrbp1Q99J45 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nrbp1Q99J45 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nrbp1Q99J45 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nrbp1Q99J45 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nrbp1Q99J45 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nrbp1Q99J45 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Nrbp1Q99J45 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Nrbp1Q99J45 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nrbp1Q99J45 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nrbp1Q99J45 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nrbp1Q99J45 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nrbp1Q99J45 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nrbp1Q99J45 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nrbp1Q99J45 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nrbp1Q99J45 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nrbp1Q99J45 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nrbp1Q99J45 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nrbp1Q99J45 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nrbp1Q99J45 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nrbp1Q99J45 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nrbp1Q99J45 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms