Protein–RNA interactions for Protein: Q91W27

Pth2, Tuberoinfundibular peptide of 39 residues, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pth2Q91W27 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pth2Q91W27 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pth2Q91W27 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pth2Q91W27 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pth2Q91W27 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pth2Q91W27 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pth2Q91W27 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pth2Q91W27 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pth2Q91W27 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pth2Q91W27 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pth2Q91W27 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pth2Q91W27 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pth2Q91W27 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pth2Q91W27 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Pth2Q91W27 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pth2Q91W27 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pth2Q91W27 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pth2Q91W27 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pth2Q91W27 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pth2Q91W27 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pth2Q91W27 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pth2Q91W27 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pth2Q91W27 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pth2Q91W27 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pth2Q91W27 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pth2Q91W27 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pth2Q91W27 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pth2Q91W27 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pth2Q91W27 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pth2Q91W27 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pth2Q91W27 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pth2Q91W27 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pth2Q91W27 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pth2Q91W27 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pth2Q91W27 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pth2Q91W27 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pth2Q91W27 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pth2Q91W27 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pth2Q91W27 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pth2Q91W27 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pth2Q91W27 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pth2Q91W27 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pth2Q91W27 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pth2Q91W27 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pth2Q91W27 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pth2Q91W27 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pth2Q91W27 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pth2Q91W27 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pth2Q91W27 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pth2Q91W27 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pth2Q91W27 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pth2Q91W27 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pth2Q91W27 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pth2Q91W27 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pth2Q91W27 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pth2Q91W27 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pth2Q91W27 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pth2Q91W27 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pth2Q91W27 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pth2Q91W27 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pth2Q91W27 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pth2Q91W27 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pth2Q91W27 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pth2Q91W27 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pth2Q91W27 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pth2Q91W27 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pth2Q91W27 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pth2Q91W27 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pth2Q91W27 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pth2Q91W27 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pth2Q91W27 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pth2Q91W27 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pth2Q91W27 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pth2Q91W27 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pth2Q91W27 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pth2Q91W27 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pth2Q91W27 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pth2Q91W27 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pth2Q91W27 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pth2Q91W27 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pth2Q91W27 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pth2Q91W27 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pth2Q91W27 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pth2Q91W27 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pth2Q91W27 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pth2Q91W27 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pth2Q91W27 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pth2Q91W27 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pth2Q91W27 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pth2Q91W27 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pth2Q91W27 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pth2Q91W27 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pth2Q91W27 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pth2Q91W27 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pth2Q91W27 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pth2Q91W27 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pth2Q91W27 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pth2Q91W27 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pth2Q91W27 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pth2Q91W27 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms