Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cbx7Q8VDS3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cbx7Q8VDS3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx7Q8VDS3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cbx7Q8VDS3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cbx7Q8VDS3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cbx7Q8VDS3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cbx7Q8VDS3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cbx7Q8VDS3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cbx7Q8VDS3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cbx7Q8VDS3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cbx7Q8VDS3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cbx7Q8VDS3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cbx7Q8VDS3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cbx7Q8VDS3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cbx7Q8VDS3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cbx7Q8VDS3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cbx7Q8VDS3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cbx7Q8VDS3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cbx7Q8VDS3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cbx7Q8VDS3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cbx7Q8VDS3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cbx7Q8VDS3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cbx7Q8VDS3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cbx7Q8VDS3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cbx7Q8VDS3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx7Q8VDS3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx7Q8VDS3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx7Q8VDS3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx7Q8VDS3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx7Q8VDS3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx7Q8VDS3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx7Q8VDS3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx7Q8VDS3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cbx7Q8VDS3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx7Q8VDS3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx7Q8VDS3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx7Q8VDS3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx7Q8VDS3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx7Q8VDS3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx7Q8VDS3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx7Q8VDS3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx7Q8VDS3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx7Q8VDS3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx7Q8VDS3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx7Q8VDS3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx7Q8VDS3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx7Q8VDS3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx7Q8VDS3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx7Q8VDS3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx7Q8VDS3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx7Q8VDS3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx7Q8VDS3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx7Q8VDS3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx7Q8VDS3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx7Q8VDS3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx7Q8VDS3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx7Q8VDS3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx7Q8VDS3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cbx7Q8VDS3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx7Q8VDS3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx7Q8VDS3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx7Q8VDS3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx7Q8VDS3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx7Q8VDS3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx7Q8VDS3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx7Q8VDS3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cbx7Q8VDS3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx7Q8VDS3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cbx7Q8VDS3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cbx7Q8VDS3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cbx7Q8VDS3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx7Q8VDS3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cbx7Q8VDS3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx7Q8VDS3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx7Q8VDS3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cbx7Q8VDS3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx7Q8VDS3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx7Q8VDS3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx7Q8VDS3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cbx7Q8VDS3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx7Q8VDS3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx7Q8VDS3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx7Q8VDS3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx7Q8VDS3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx7Q8VDS3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx7Q8VDS3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx7Q8VDS3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx7Q8VDS3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx7Q8VDS3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx7Q8VDS3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx7Q8VDS3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx7Q8VDS3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx7Q8VDS3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx7Q8VDS3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx7Q8VDS3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx7Q8VDS3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx7Q8VDS3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx7Q8VDS3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx7Q8VDS3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms