Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDD8

Washc1, WASH complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc1Q8VDD8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Washc1Q8VDD8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Washc1Q8VDD8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Washc1Q8VDD8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Washc1Q8VDD8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Washc1Q8VDD8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Washc1Q8VDD8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Washc1Q8VDD8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Washc1Q8VDD8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Washc1Q8VDD8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Washc1Q8VDD8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Washc1Q8VDD8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Washc1Q8VDD8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Washc1Q8VDD8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Washc1Q8VDD8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Washc1Q8VDD8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Washc1Q8VDD8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Washc1Q8VDD8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Washc1Q8VDD8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Washc1Q8VDD8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Washc1Q8VDD8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Washc1Q8VDD8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Washc1Q8VDD8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Washc1Q8VDD8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Washc1Q8VDD8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Washc1Q8VDD8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Washc1Q8VDD8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Washc1Q8VDD8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Washc1Q8VDD8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Washc1Q8VDD8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Washc1Q8VDD8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Washc1Q8VDD8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Washc1Q8VDD8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Washc1Q8VDD8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Washc1Q8VDD8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Washc1Q8VDD8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Washc1Q8VDD8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Washc1Q8VDD8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Washc1Q8VDD8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Washc1Q8VDD8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Washc1Q8VDD8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Washc1Q8VDD8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Washc1Q8VDD8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Washc1Q8VDD8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Washc1Q8VDD8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Washc1Q8VDD8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Washc1Q8VDD8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Washc1Q8VDD8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Washc1Q8VDD8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Washc1Q8VDD8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Washc1Q8VDD8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Washc1Q8VDD8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Washc1Q8VDD8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Washc1Q8VDD8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Washc1Q8VDD8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Washc1Q8VDD8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Washc1Q8VDD8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Washc1Q8VDD8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Washc1Q8VDD8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Washc1Q8VDD8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Washc1Q8VDD8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Washc1Q8VDD8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Washc1Q8VDD8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Washc1Q8VDD8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Washc1Q8VDD8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Washc1Q8VDD8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Washc1Q8VDD8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Washc1Q8VDD8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Washc1Q8VDD8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Washc1Q8VDD8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Washc1Q8VDD8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Washc1Q8VDD8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Washc1Q8VDD8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Washc1Q8VDD8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Washc1Q8VDD8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Washc1Q8VDD8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Washc1Q8VDD8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Washc1Q8VDD8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Washc1Q8VDD8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Washc1Q8VDD8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Washc1Q8VDD8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Washc1Q8VDD8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Washc1Q8VDD8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Washc1Q8VDD8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Washc1Q8VDD8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Washc1Q8VDD8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Washc1Q8VDD8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Washc1Q8VDD8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Washc1Q8VDD8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Washc1Q8VDD8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Washc1Q8VDD8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Washc1Q8VDD8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Washc1Q8VDD8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Washc1Q8VDD8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Washc1Q8VDD8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Washc1Q8VDD8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Washc1Q8VDD8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Washc1Q8VDD8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Washc1Q8VDD8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Washc1Q8VDD8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms