Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc58Q8R3Q6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc58Q8R3Q6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc58Q8R3Q6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc58Q8R3Q6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc58Q8R3Q6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc58Q8R3Q6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc58Q8R3Q6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc58Q8R3Q6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc58Q8R3Q6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc58Q8R3Q6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc58Q8R3Q6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc58Q8R3Q6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc58Q8R3Q6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc58Q8R3Q6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc58Q8R3Q6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc58Q8R3Q6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc58Q8R3Q6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc58Q8R3Q6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc58Q8R3Q6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc58Q8R3Q6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc58Q8R3Q6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc58Q8R3Q6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc58Q8R3Q6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc58Q8R3Q6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc58Q8R3Q6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc58Q8R3Q6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc58Q8R3Q6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc58Q8R3Q6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc58Q8R3Q6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc58Q8R3Q6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc58Q8R3Q6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc58Q8R3Q6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc58Q8R3Q6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc58Q8R3Q6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc58Q8R3Q6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc58Q8R3Q6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc58Q8R3Q6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc58Q8R3Q6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc58Q8R3Q6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc58Q8R3Q6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc58Q8R3Q6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc58Q8R3Q6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc58Q8R3Q6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc58Q8R3Q6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc58Q8R3Q6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc58Q8R3Q6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc58Q8R3Q6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc58Q8R3Q6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc58Q8R3Q6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc58Q8R3Q6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc58Q8R3Q6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc58Q8R3Q6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc58Q8R3Q6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc58Q8R3Q6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc58Q8R3Q6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc58Q8R3Q6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc58Q8R3Q6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc58Q8R3Q6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc58Q8R3Q6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc58Q8R3Q6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc58Q8R3Q6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc58Q8R3Q6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc58Q8R3Q6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc58Q8R3Q6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc58Q8R3Q6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc58Q8R3Q6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc58Q8R3Q6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc58Q8R3Q6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc58Q8R3Q6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc58Q8R3Q6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc58Q8R3Q6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc58Q8R3Q6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc58Q8R3Q6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc58Q8R3Q6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc58Q8R3Q6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc58Q8R3Q6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc58Q8R3Q6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc58Q8R3Q6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc58Q8R3Q6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc58Q8R3Q6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc58Q8R3Q6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc58Q8R3Q6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc58Q8R3Q6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc58Q8R3Q6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc58Q8R3Q6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms