Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3N6

Thoc1, THO complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc1Q8R3N6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Thoc1Q8R3N6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Thoc1Q8R3N6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Thoc1Q8R3N6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Thoc1Q8R3N6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Thoc1Q8R3N6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Thoc1Q8R3N6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Thoc1Q8R3N6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Thoc1Q8R3N6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Thoc1Q8R3N6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Thoc1Q8R3N6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Thoc1Q8R3N6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Thoc1Q8R3N6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Thoc1Q8R3N6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Thoc1Q8R3N6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Thoc1Q8R3N6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Thoc1Q8R3N6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Thoc1Q8R3N6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Thoc1Q8R3N6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Thoc1Q8R3N6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Thoc1Q8R3N6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Thoc1Q8R3N6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Thoc1Q8R3N6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Thoc1Q8R3N6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Thoc1Q8R3N6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Thoc1Q8R3N6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thoc1Q8R3N6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Thoc1Q8R3N6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thoc1Q8R3N6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Thoc1Q8R3N6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Thoc1Q8R3N6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Thoc1Q8R3N6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thoc1Q8R3N6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Thoc1Q8R3N6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Thoc1Q8R3N6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thoc1Q8R3N6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thoc1Q8R3N6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thoc1Q8R3N6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thoc1Q8R3N6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thoc1Q8R3N6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thoc1Q8R3N6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Thoc1Q8R3N6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thoc1Q8R3N6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thoc1Q8R3N6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thoc1Q8R3N6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thoc1Q8R3N6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Thoc1Q8R3N6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Thoc1Q8R3N6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Thoc1Q8R3N6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Thoc1Q8R3N6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Thoc1Q8R3N6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Thoc1Q8R3N6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Thoc1Q8R3N6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Thoc1Q8R3N6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Thoc1Q8R3N6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Thoc1Q8R3N6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Thoc1Q8R3N6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Thoc1Q8R3N6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Thoc1Q8R3N6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Thoc1Q8R3N6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thoc1Q8R3N6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thoc1Q8R3N6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thoc1Q8R3N6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thoc1Q8R3N6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thoc1Q8R3N6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thoc1Q8R3N6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Thoc1Q8R3N6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Thoc1Q8R3N6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thoc1Q8R3N6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Thoc1Q8R3N6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thoc1Q8R3N6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thoc1Q8R3N6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Thoc1Q8R3N6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Thoc1Q8R3N6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Thoc1Q8R3N6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Thoc1Q8R3N6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Thoc1Q8R3N6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Thoc1Q8R3N6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Thoc1Q8R3N6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Thoc1Q8R3N6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thoc1Q8R3N6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thoc1Q8R3N6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thoc1Q8R3N6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thoc1Q8R3N6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Thoc1Q8R3N6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Thoc1Q8R3N6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Thoc1Q8R3N6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Thoc1Q8R3N6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Thoc1Q8R3N6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Thoc1Q8R3N6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Thoc1Q8R3N6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Thoc1Q8R3N6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Thoc1Q8R3N6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Thoc1Q8R3N6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Thoc1Q8R3N6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Thoc1Q8R3N6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Thoc1Q8R3N6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Thoc1Q8R3N6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Thoc1Q8R3N6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Thoc1Q8R3N6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms