Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxc12Q8K5B8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxc12Q8K5B8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxc12Q8K5B8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxc12Q8K5B8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxc12Q8K5B8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxc12Q8K5B8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxc12Q8K5B8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxc12Q8K5B8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxc12Q8K5B8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc12Q8K5B8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc12Q8K5B8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxc12Q8K5B8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc12Q8K5B8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc12Q8K5B8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc12Q8K5B8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc12Q8K5B8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc12Q8K5B8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc12Q8K5B8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc12Q8K5B8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc12Q8K5B8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc12Q8K5B8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc12Q8K5B8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc12Q8K5B8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxc12Q8K5B8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxc12Q8K5B8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc12Q8K5B8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc12Q8K5B8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc12Q8K5B8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc12Q8K5B8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc12Q8K5B8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc12Q8K5B8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc12Q8K5B8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc12Q8K5B8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc12Q8K5B8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc12Q8K5B8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc12Q8K5B8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc12Q8K5B8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc12Q8K5B8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc12Q8K5B8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc12Q8K5B8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc12Q8K5B8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc12Q8K5B8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc12Q8K5B8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc12Q8K5B8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc12Q8K5B8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc12Q8K5B8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc12Q8K5B8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc12Q8K5B8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc12Q8K5B8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc12Q8K5B8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc12Q8K5B8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc12Q8K5B8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc12Q8K5B8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc12Q8K5B8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxc12Q8K5B8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxc12Q8K5B8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc12Q8K5B8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc12Q8K5B8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc12Q8K5B8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc12Q8K5B8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc12Q8K5B8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc12Q8K5B8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc12Q8K5B8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc12Q8K5B8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc12Q8K5B8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc12Q8K5B8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc12Q8K5B8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc12Q8K5B8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc12Q8K5B8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc12Q8K5B8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc12Q8K5B8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc12Q8K5B8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc12Q8K5B8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc12Q8K5B8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc12Q8K5B8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc12Q8K5B8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc12Q8K5B8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc12Q8K5B8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc12Q8K5B8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc12Q8K5B8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc12Q8K5B8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc12Q8K5B8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc12Q8K5B8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc12Q8K5B8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc12Q8K5B8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc12Q8K5B8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc12Q8K5B8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc12Q8K5B8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc12Q8K5B8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc12Q8K5B8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc12Q8K5B8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc12Q8K5B8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc12Q8K5B8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc12Q8K5B8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc12Q8K5B8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc12Q8K5B8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms