Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Foxn4Q8K3Q3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Foxn4Q8K3Q3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Foxn4Q8K3Q3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Foxn4Q8K3Q3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Foxn4Q8K3Q3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Foxn4Q8K3Q3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Foxn4Q8K3Q3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Foxn4Q8K3Q3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Foxn4Q8K3Q3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Foxn4Q8K3Q3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Foxn4Q8K3Q3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Foxn4Q8K3Q3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Foxn4Q8K3Q3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Foxn4Q8K3Q3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Foxn4Q8K3Q3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Foxn4Q8K3Q3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Foxn4Q8K3Q3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Foxn4Q8K3Q3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Foxn4Q8K3Q3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Foxn4Q8K3Q3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Foxn4Q8K3Q3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Foxn4Q8K3Q3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Foxn4Q8K3Q3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Foxn4Q8K3Q3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Foxn4Q8K3Q3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxn4Q8K3Q3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxn4Q8K3Q3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Foxn4Q8K3Q3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxn4Q8K3Q3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxn4Q8K3Q3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxn4Q8K3Q3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxn4Q8K3Q3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxn4Q8K3Q3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxn4Q8K3Q3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxn4Q8K3Q3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxn4Q8K3Q3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxn4Q8K3Q3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxn4Q8K3Q3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxn4Q8K3Q3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxn4Q8K3Q3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxn4Q8K3Q3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxn4Q8K3Q3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxn4Q8K3Q3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxn4Q8K3Q3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxn4Q8K3Q3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxn4Q8K3Q3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxn4Q8K3Q3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxn4Q8K3Q3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxn4Q8K3Q3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxn4Q8K3Q3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxn4Q8K3Q3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxn4Q8K3Q3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxn4Q8K3Q3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxn4Q8K3Q3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxn4Q8K3Q3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxn4Q8K3Q3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxn4Q8K3Q3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxn4Q8K3Q3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxn4Q8K3Q3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxn4Q8K3Q3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Foxn4Q8K3Q3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxn4Q8K3Q3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxn4Q8K3Q3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxn4Q8K3Q3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxn4Q8K3Q3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxn4Q8K3Q3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxn4Q8K3Q3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxn4Q8K3Q3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxn4Q8K3Q3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxn4Q8K3Q3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxn4Q8K3Q3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxn4Q8K3Q3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Foxn4Q8K3Q3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Foxn4Q8K3Q3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Foxn4Q8K3Q3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Foxn4Q8K3Q3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Foxn4Q8K3Q3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxn4Q8K3Q3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxn4Q8K3Q3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxn4Q8K3Q3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxn4Q8K3Q3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxn4Q8K3Q3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxn4Q8K3Q3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxn4Q8K3Q3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxn4Q8K3Q3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxn4Q8K3Q3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxn4Q8K3Q3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxn4Q8K3Q3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxn4Q8K3Q3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxn4Q8K3Q3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Foxn4Q8K3Q3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxn4Q8K3Q3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxn4Q8K3Q3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxn4Q8K3Q3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxn4Q8K3Q3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxn4Q8K3Q3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxn4Q8K3Q3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxn4Q8K3Q3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxn4Q8K3Q3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 474.9 ms