Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0S9

Snapc1, snRNA-activating protein complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc1Q8K0S9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snapc1Q8K0S9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snapc1Q8K0S9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Snapc1Q8K0S9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snapc1Q8K0S9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snapc1Q8K0S9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snapc1Q8K0S9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snapc1Q8K0S9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snapc1Q8K0S9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Snapc1Q8K0S9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snapc1Q8K0S9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snapc1Q8K0S9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snapc1Q8K0S9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snapc1Q8K0S9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snapc1Q8K0S9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snapc1Q8K0S9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snapc1Q8K0S9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snapc1Q8K0S9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snapc1Q8K0S9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snapc1Q8K0S9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snapc1Q8K0S9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snapc1Q8K0S9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snapc1Q8K0S9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snapc1Q8K0S9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snapc1Q8K0S9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snapc1Q8K0S9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snapc1Q8K0S9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snapc1Q8K0S9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snapc1Q8K0S9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snapc1Q8K0S9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snapc1Q8K0S9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snapc1Q8K0S9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snapc1Q8K0S9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snapc1Q8K0S9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Snapc1Q8K0S9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snapc1Q8K0S9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snapc1Q8K0S9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Snapc1Q8K0S9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snapc1Q8K0S9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snapc1Q8K0S9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snapc1Q8K0S9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snapc1Q8K0S9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Snapc1Q8K0S9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snapc1Q8K0S9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Snapc1Q8K0S9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snapc1Q8K0S9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snapc1Q8K0S9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snapc1Q8K0S9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snapc1Q8K0S9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snapc1Q8K0S9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snapc1Q8K0S9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snapc1Q8K0S9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snapc1Q8K0S9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snapc1Q8K0S9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snapc1Q8K0S9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snapc1Q8K0S9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snapc1Q8K0S9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snapc1Q8K0S9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snapc1Q8K0S9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snapc1Q8K0S9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snapc1Q8K0S9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snapc1Q8K0S9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snapc1Q8K0S9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snapc1Q8K0S9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snapc1Q8K0S9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snapc1Q8K0S9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snapc1Q8K0S9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snapc1Q8K0S9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snapc1Q8K0S9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snapc1Q8K0S9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snapc1Q8K0S9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snapc1Q8K0S9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snapc1Q8K0S9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snapc1Q8K0S9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snapc1Q8K0S9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snapc1Q8K0S9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Snapc1Q8K0S9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snapc1Q8K0S9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snapc1Q8K0S9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snapc1Q8K0S9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snapc1Q8K0S9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snapc1Q8K0S9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snapc1Q8K0S9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snapc1Q8K0S9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snapc1Q8K0S9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snapc1Q8K0S9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snapc1Q8K0S9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snapc1Q8K0S9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snapc1Q8K0S9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snapc1Q8K0S9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snapc1Q8K0S9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snapc1Q8K0S9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snapc1Q8K0S9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snapc1Q8K0S9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snapc1Q8K0S9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snapc1Q8K0S9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snapc1Q8K0S9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snapc1Q8K0S9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snapc1Q8K0S9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snapc1Q8K0S9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms