Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D5

Gfm1, Elongation factor G, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfm1Q8K0D5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gfm1Q8K0D5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gfm1Q8K0D5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gfm1Q8K0D5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gfm1Q8K0D5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gfm1Q8K0D5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gfm1Q8K0D5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gfm1Q8K0D5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gfm1Q8K0D5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gfm1Q8K0D5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gfm1Q8K0D5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gfm1Q8K0D5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gfm1Q8K0D5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gfm1Q8K0D5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gfm1Q8K0D5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gfm1Q8K0D5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gfm1Q8K0D5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gfm1Q8K0D5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gfm1Q8K0D5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gfm1Q8K0D5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gfm1Q8K0D5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gfm1Q8K0D5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gfm1Q8K0D5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gfm1Q8K0D5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gfm1Q8K0D5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gfm1Q8K0D5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gfm1Q8K0D5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gfm1Q8K0D5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gfm1Q8K0D5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gfm1Q8K0D5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gfm1Q8K0D5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gfm1Q8K0D5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gfm1Q8K0D5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gfm1Q8K0D5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gfm1Q8K0D5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gfm1Q8K0D5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gfm1Q8K0D5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gfm1Q8K0D5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gfm1Q8K0D5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gfm1Q8K0D5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gfm1Q8K0D5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gfm1Q8K0D5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gfm1Q8K0D5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gfm1Q8K0D5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gfm1Q8K0D5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gfm1Q8K0D5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gfm1Q8K0D5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gfm1Q8K0D5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gfm1Q8K0D5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gfm1Q8K0D5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gfm1Q8K0D5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gfm1Q8K0D5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gfm1Q8K0D5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gfm1Q8K0D5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gfm1Q8K0D5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gfm1Q8K0D5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gfm1Q8K0D5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfm1Q8K0D5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfm1Q8K0D5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfm1Q8K0D5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfm1Q8K0D5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfm1Q8K0D5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gfm1Q8K0D5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gfm1Q8K0D5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gfm1Q8K0D5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gfm1Q8K0D5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gfm1Q8K0D5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gfm1Q8K0D5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gfm1Q8K0D5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfm1Q8K0D5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfm1Q8K0D5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfm1Q8K0D5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfm1Q8K0D5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gfm1Q8K0D5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gfm1Q8K0D5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gfm1Q8K0D5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gfm1Q8K0D5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gfm1Q8K0D5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gfm1Q8K0D5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gfm1Q8K0D5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gfm1Q8K0D5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gfm1Q8K0D5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gfm1Q8K0D5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gfm1Q8K0D5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gfm1Q8K0D5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gfm1Q8K0D5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gfm1Q8K0D5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gfm1Q8K0D5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gfm1Q8K0D5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gfm1Q8K0D5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gfm1Q8K0D5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gfm1Q8K0D5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gfm1Q8K0D5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gfm1Q8K0D5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gfm1Q8K0D5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gfm1Q8K0D5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gfm1Q8K0D5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gfm1Q8K0D5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gfm1Q8K0D5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gfm1Q8K0D5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms