Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh2d5Q8JZW5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh2d5Q8JZW5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh2d5Q8JZW5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh2d5Q8JZW5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sh2d5Q8JZW5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh2d5Q8JZW5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh2d5Q8JZW5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh2d5Q8JZW5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh2d5Q8JZW5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh2d5Q8JZW5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh2d5Q8JZW5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh2d5Q8JZW5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh2d5Q8JZW5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh2d5Q8JZW5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh2d5Q8JZW5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh2d5Q8JZW5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sh2d5Q8JZW5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sh2d5Q8JZW5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh2d5Q8JZW5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sh2d5Q8JZW5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sh2d5Q8JZW5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sh2d5Q8JZW5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sh2d5Q8JZW5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sh2d5Q8JZW5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sh2d5Q8JZW5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sh2d5Q8JZW5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sh2d5Q8JZW5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sh2d5Q8JZW5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sh2d5Q8JZW5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sh2d5Q8JZW5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sh2d5Q8JZW5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sh2d5Q8JZW5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sh2d5Q8JZW5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Sh2d5Q8JZW5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sh2d5Q8JZW5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh2d5Q8JZW5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh2d5Q8JZW5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh2d5Q8JZW5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sh2d5Q8JZW5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sh2d5Q8JZW5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh2d5Q8JZW5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh2d5Q8JZW5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh2d5Q8JZW5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sh2d5Q8JZW5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms