Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpne5Q8JZW4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpne5Q8JZW4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpne5Q8JZW4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpne5Q8JZW4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpne5Q8JZW4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpne5Q8JZW4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpne5Q8JZW4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpne5Q8JZW4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpne5Q8JZW4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpne5Q8JZW4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpne5Q8JZW4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpne5Q8JZW4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpne5Q8JZW4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpne5Q8JZW4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpne5Q8JZW4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpne5Q8JZW4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne5Q8JZW4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne5Q8JZW4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpne5Q8JZW4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpne5Q8JZW4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpne5Q8JZW4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpne5Q8JZW4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpne5Q8JZW4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpne5Q8JZW4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpne5Q8JZW4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpne5Q8JZW4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpne5Q8JZW4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpne5Q8JZW4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpne5Q8JZW4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpne5Q8JZW4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpne5Q8JZW4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpne5Q8JZW4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpne5Q8JZW4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpne5Q8JZW4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpne5Q8JZW4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpne5Q8JZW4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpne5Q8JZW4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpne5Q8JZW4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpne5Q8JZW4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cpne5Q8JZW4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpne5Q8JZW4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpne5Q8JZW4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpne5Q8JZW4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpne5Q8JZW4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpne5Q8JZW4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpne5Q8JZW4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpne5Q8JZW4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpne5Q8JZW4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpne5Q8JZW4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpne5Q8JZW4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpne5Q8JZW4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpne5Q8JZW4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpne5Q8JZW4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpne5Q8JZW4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpne5Q8JZW4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpne5Q8JZW4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpne5Q8JZW4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpne5Q8JZW4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpne5Q8JZW4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpne5Q8JZW4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpne5Q8JZW4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpne5Q8JZW4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpne5Q8JZW4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpne5Q8JZW4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpne5Q8JZW4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpne5Q8JZW4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpne5Q8JZW4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpne5Q8JZW4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpne5Q8JZW4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpne5Q8JZW4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpne5Q8JZW4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpne5Q8JZW4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpne5Q8JZW4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpne5Q8JZW4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpne5Q8JZW4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpne5Q8JZW4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpne5Q8JZW4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpne5Q8JZW4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpne5Q8JZW4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpne5Q8JZW4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpne5Q8JZW4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpne5Q8JZW4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpne5Q8JZW4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpne5Q8JZW4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpne5Q8JZW4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpne5Q8JZW4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpne5Q8JZW4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpne5Q8JZW4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpne5Q8JZW4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpne5Q8JZW4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpne5Q8JZW4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpne5Q8JZW4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpne5Q8JZW4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpne5Q8JZW4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpne5Q8JZW4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpne5Q8JZW4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpne5Q8JZW4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpne5Q8JZW4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpne5Q8JZW4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms