Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Znf628Q8CJ78 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf628Q8CJ78 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znf628Q8CJ78 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Znf628Q8CJ78 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf628Q8CJ78 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf628Q8CJ78 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf628Q8CJ78 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf628Q8CJ78 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf628Q8CJ78 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf628Q8CJ78 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf628Q8CJ78 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf628Q8CJ78 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf628Q8CJ78 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf628Q8CJ78 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Znf628Q8CJ78 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Znf628Q8CJ78 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Znf628Q8CJ78 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Znf628Q8CJ78 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Znf628Q8CJ78 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Znf628Q8CJ78 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Znf628Q8CJ78 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf628Q8CJ78 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf628Q8CJ78 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf628Q8CJ78 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf628Q8CJ78 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf628Q8CJ78 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf628Q8CJ78 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf628Q8CJ78 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf628Q8CJ78 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf628Q8CJ78 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Znf628Q8CJ78 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Znf628Q8CJ78 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf628Q8CJ78 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf628Q8CJ78 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf628Q8CJ78 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf628Q8CJ78 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf628Q8CJ78 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf628Q8CJ78 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf628Q8CJ78 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf628Q8CJ78 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Znf628Q8CJ78 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Znf628Q8CJ78 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Znf628Q8CJ78 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Znf628Q8CJ78 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf628Q8CJ78 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf628Q8CJ78 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf628Q8CJ78 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf628Q8CJ78 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf628Q8CJ78 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf628Q8CJ78 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf628Q8CJ78 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf628Q8CJ78 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf628Q8CJ78 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf628Q8CJ78 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf628Q8CJ78 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf628Q8CJ78 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf628Q8CJ78 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf628Q8CJ78 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf628Q8CJ78 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Znf628Q8CJ78 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Znf628Q8CJ78 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Znf628Q8CJ78 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Znf628Q8CJ78 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf628Q8CJ78 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf628Q8CJ78 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf628Q8CJ78 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf628Q8CJ78 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf628Q8CJ78 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf628Q8CJ78 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf628Q8CJ78 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf628Q8CJ78 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf628Q8CJ78 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf628Q8CJ78 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf628Q8CJ78 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf628Q8CJ78 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf628Q8CJ78 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf628Q8CJ78 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf628Q8CJ78 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf628Q8CJ78 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf628Q8CJ78 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf628Q8CJ78 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf628Q8CJ78 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf628Q8CJ78 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf628Q8CJ78 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf628Q8CJ78 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf628Q8CJ78 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf628Q8CJ78 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf628Q8CJ78 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf628Q8CJ78 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf628Q8CJ78 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf628Q8CJ78 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf628Q8CJ78 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf628Q8CJ78 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf628Q8CJ78 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf628Q8CJ78 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf628Q8CJ78 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf628Q8CJ78 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf628Q8CJ78 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf628Q8CJ78 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms