Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ9

4932414N04Rik, RIKEN cDNA 4932414N04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4932414N04RikQ8CEQ9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4932414N04RikQ8CEQ9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
4932414N04RikQ8CEQ9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4932414N04RikQ8CEQ9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4932414N04RikQ8CEQ9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4932414N04RikQ8CEQ9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4932414N04RikQ8CEQ9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4932414N04RikQ8CEQ9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
4932414N04RikQ8CEQ9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4932414N04RikQ8CEQ9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4932414N04RikQ8CEQ9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4932414N04RikQ8CEQ9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4932414N04RikQ8CEQ9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4932414N04RikQ8CEQ9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
4932414N04RikQ8CEQ9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
4932414N04RikQ8CEQ9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
4932414N04RikQ8CEQ9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
4932414N04RikQ8CEQ9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4932414N04RikQ8CEQ9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4932414N04RikQ8CEQ9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4932414N04RikQ8CEQ9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4932414N04RikQ8CEQ9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4932414N04RikQ8CEQ9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4932414N04RikQ8CEQ9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4932414N04RikQ8CEQ9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
4932414N04RikQ8CEQ9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
4932414N04RikQ8CEQ9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4932414N04RikQ8CEQ9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4932414N04RikQ8CEQ9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4932414N04RikQ8CEQ9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4932414N04RikQ8CEQ9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4932414N04RikQ8CEQ9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
4932414N04RikQ8CEQ9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4932414N04RikQ8CEQ9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4932414N04RikQ8CEQ9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4932414N04RikQ8CEQ9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4932414N04RikQ8CEQ9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4932414N04RikQ8CEQ9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4932414N04RikQ8CEQ9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4932414N04RikQ8CEQ9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
4932414N04RikQ8CEQ9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4932414N04RikQ8CEQ9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4932414N04RikQ8CEQ9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4932414N04RikQ8CEQ9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4932414N04RikQ8CEQ9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4932414N04RikQ8CEQ9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4932414N04RikQ8CEQ9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4932414N04RikQ8CEQ9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4932414N04RikQ8CEQ9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4932414N04RikQ8CEQ9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4932414N04RikQ8CEQ9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
4932414N04RikQ8CEQ9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4932414N04RikQ8CEQ9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4932414N04RikQ8CEQ9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4932414N04RikQ8CEQ9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4932414N04RikQ8CEQ9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4932414N04RikQ8CEQ9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4932414N04RikQ8CEQ9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
4932414N04RikQ8CEQ9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4932414N04RikQ8CEQ9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4932414N04RikQ8CEQ9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4932414N04RikQ8CEQ9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
4932414N04RikQ8CEQ9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
4932414N04RikQ8CEQ9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
4932414N04RikQ8CEQ9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4932414N04RikQ8CEQ9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4932414N04RikQ8CEQ9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4932414N04RikQ8CEQ9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4932414N04RikQ8CEQ9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4932414N04RikQ8CEQ9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4932414N04RikQ8CEQ9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4932414N04RikQ8CEQ9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4932414N04RikQ8CEQ9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4932414N04RikQ8CEQ9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4932414N04RikQ8CEQ9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4932414N04RikQ8CEQ9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4932414N04RikQ8CEQ9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4932414N04RikQ8CEQ9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4932414N04RikQ8CEQ9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4932414N04RikQ8CEQ9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
4932414N04RikQ8CEQ9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
4932414N04RikQ8CEQ9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
4932414N04RikQ8CEQ9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
4932414N04RikQ8CEQ9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4932414N04RikQ8CEQ9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4932414N04RikQ8CEQ9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4932414N04RikQ8CEQ9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4932414N04RikQ8CEQ9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4932414N04RikQ8CEQ9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4932414N04RikQ8CEQ9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
4932414N04RikQ8CEQ9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4932414N04RikQ8CEQ9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4932414N04RikQ8CEQ9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms