Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc28bQ8CEG5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc28bQ8CEG5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc28bQ8CEG5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc28bQ8CEG5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc28bQ8CEG5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc28bQ8CEG5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc28bQ8CEG5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc28bQ8CEG5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc28bQ8CEG5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc28bQ8CEG5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc28bQ8CEG5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc28bQ8CEG5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc28bQ8CEG5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc28bQ8CEG5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc28bQ8CEG5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc28bQ8CEG5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc28bQ8CEG5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc28bQ8CEG5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc28bQ8CEG5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc28bQ8CEG5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc28bQ8CEG5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc28bQ8CEG5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc28bQ8CEG5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc28bQ8CEG5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc28bQ8CEG5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc28bQ8CEG5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc28bQ8CEG5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc28bQ8CEG5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc28bQ8CEG5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc28bQ8CEG5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc28bQ8CEG5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc28bQ8CEG5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc28bQ8CEG5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc28bQ8CEG5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc28bQ8CEG5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc28bQ8CEG5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc28bQ8CEG5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc28bQ8CEG5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc28bQ8CEG5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc28bQ8CEG5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc28bQ8CEG5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc28bQ8CEG5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc28bQ8CEG5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc28bQ8CEG5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc28bQ8CEG5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc28bQ8CEG5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms