Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
9030612E09RikQ8CE20 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
9030612E09RikQ8CE20 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
9030612E09RikQ8CE20 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
9030612E09RikQ8CE20 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
9030612E09RikQ8CE20 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
9030612E09RikQ8CE20 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
9030612E09RikQ8CE20 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
9030612E09RikQ8CE20 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
9030612E09RikQ8CE20 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
9030612E09RikQ8CE20 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
9030612E09RikQ8CE20 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
9030612E09RikQ8CE20 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
9030612E09RikQ8CE20 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
9030612E09RikQ8CE20 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
9030612E09RikQ8CE20 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
9030612E09RikQ8CE20 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
9030612E09RikQ8CE20 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
9030612E09RikQ8CE20 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
9030612E09RikQ8CE20 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
9030612E09RikQ8CE20 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
9030612E09RikQ8CE20 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
9030612E09RikQ8CE20 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
9030612E09RikQ8CE20 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
9030612E09RikQ8CE20 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
9030612E09RikQ8CE20 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
9030612E09RikQ8CE20 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
9030612E09RikQ8CE20 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
9030612E09RikQ8CE20 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
9030612E09RikQ8CE20 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
9030612E09RikQ8CE20 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
9030612E09RikQ8CE20 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
9030612E09RikQ8CE20 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
9030612E09RikQ8CE20 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
9030612E09RikQ8CE20 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
9030612E09RikQ8CE20 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
9030612E09RikQ8CE20 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
9030612E09RikQ8CE20 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
9030612E09RikQ8CE20 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
9030612E09RikQ8CE20 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
9030612E09RikQ8CE20 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
9030612E09RikQ8CE20 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
9030612E09RikQ8CE20 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
9030612E09RikQ8CE20 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
9030612E09RikQ8CE20 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
9030612E09RikQ8CE20 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
9030612E09RikQ8CE20 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
9030612E09RikQ8CE20 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
9030612E09RikQ8CE20 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
9030612E09RikQ8CE20 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
9030612E09RikQ8CE20 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
9030612E09RikQ8CE20 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
9030612E09RikQ8CE20 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
9030612E09RikQ8CE20 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
9030612E09RikQ8CE20 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
9030612E09RikQ8CE20 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
9030612E09RikQ8CE20 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
9030612E09RikQ8CE20 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
9030612E09RikQ8CE20 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
9030612E09RikQ8CE20 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
9030612E09RikQ8CE20 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
9030612E09RikQ8CE20 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
9030612E09RikQ8CE20 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
9030612E09RikQ8CE20 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
9030612E09RikQ8CE20 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
9030612E09RikQ8CE20 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
9030612E09RikQ8CE20 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
9030612E09RikQ8CE20 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
9030612E09RikQ8CE20 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
9030612E09RikQ8CE20 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
9030612E09RikQ8CE20 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
9030612E09RikQ8CE20 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
9030612E09RikQ8CE20 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
9030612E09RikQ8CE20 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
9030612E09RikQ8CE20 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
9030612E09RikQ8CE20 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
9030612E09RikQ8CE20 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
9030612E09RikQ8CE20 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
9030612E09RikQ8CE20 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
9030612E09RikQ8CE20 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
9030612E09RikQ8CE20 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
9030612E09RikQ8CE20 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
9030612E09RikQ8CE20 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
9030612E09RikQ8CE20 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
9030612E09RikQ8CE20 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
9030612E09RikQ8CE20 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
9030612E09RikQ8CE20 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
9030612E09RikQ8CE20 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
9030612E09RikQ8CE20 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
9030612E09RikQ8CE20 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
9030612E09RikQ8CE20 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
9030612E09RikQ8CE20 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
9030612E09RikQ8CE20 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
9030612E09RikQ8CE20 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
9030612E09RikQ8CE20 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
9030612E09RikQ8CE20 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
9030612E09RikQ8CE20 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
9030612E09RikQ8CE20 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
9030612E09RikQ8CE20 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
9030612E09RikQ8CE20 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms