Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubqln3Q8C5U9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubqln3Q8C5U9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubqln3Q8C5U9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubqln3Q8C5U9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubqln3Q8C5U9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubqln3Q8C5U9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubqln3Q8C5U9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubqln3Q8C5U9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubqln3Q8C5U9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubqln3Q8C5U9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubqln3Q8C5U9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubqln3Q8C5U9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubqln3Q8C5U9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubqln3Q8C5U9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubqln3Q8C5U9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubqln3Q8C5U9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubqln3Q8C5U9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubqln3Q8C5U9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ubqln3Q8C5U9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ubqln3Q8C5U9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubqln3Q8C5U9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubqln3Q8C5U9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubqln3Q8C5U9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubqln3Q8C5U9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubqln3Q8C5U9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubqln3Q8C5U9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubqln3Q8C5U9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubqln3Q8C5U9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubqln3Q8C5U9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubqln3Q8C5U9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubqln3Q8C5U9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubqln3Q8C5U9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubqln3Q8C5U9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubqln3Q8C5U9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubqln3Q8C5U9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubqln3Q8C5U9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ubqln3Q8C5U9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubqln3Q8C5U9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubqln3Q8C5U9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubqln3Q8C5U9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubqln3Q8C5U9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubqln3Q8C5U9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubqln3Q8C5U9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubqln3Q8C5U9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubqln3Q8C5U9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubqln3Q8C5U9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubqln3Q8C5U9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubqln3Q8C5U9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubqln3Q8C5U9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ubqln3Q8C5U9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubqln3Q8C5U9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ubqln3Q8C5U9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ubqln3Q8C5U9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubqln3Q8C5U9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubqln3Q8C5U9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubqln3Q8C5U9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubqln3Q8C5U9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubqln3Q8C5U9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubqln3Q8C5U9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubqln3Q8C5U9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubqln3Q8C5U9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubqln3Q8C5U9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubqln3Q8C5U9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubqln3Q8C5U9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubqln3Q8C5U9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubqln3Q8C5U9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubqln3Q8C5U9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubqln3Q8C5U9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubqln3Q8C5U9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubqln3Q8C5U9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubqln3Q8C5U9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubqln3Q8C5U9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubqln3Q8C5U9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubqln3Q8C5U9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubqln3Q8C5U9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubqln3Q8C5U9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubqln3Q8C5U9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubqln3Q8C5U9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubqln3Q8C5U9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubqln3Q8C5U9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubqln3Q8C5U9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubqln3Q8C5U9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubqln3Q8C5U9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubqln3Q8C5U9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubqln3Q8C5U9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubqln3Q8C5U9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubqln3Q8C5U9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubqln3Q8C5U9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubqln3Q8C5U9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubqln3Q8C5U9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubqln3Q8C5U9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubqln3Q8C5U9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubqln3Q8C5U9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubqln3Q8C5U9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubqln3Q8C5U9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubqln3Q8C5U9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubqln3Q8C5U9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubqln3Q8C5U9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubqln3Q8C5U9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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