Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
4933409G03RikQ8C5U0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
4933409G03RikQ8C5U0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
4933409G03RikQ8C5U0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
4933409G03RikQ8C5U0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
4933409G03RikQ8C5U0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
4933409G03RikQ8C5U0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
4933409G03RikQ8C5U0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
4933409G03RikQ8C5U0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
4933409G03RikQ8C5U0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
4933409G03RikQ8C5U0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
4933409G03RikQ8C5U0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
4933409G03RikQ8C5U0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
4933409G03RikQ8C5U0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
4933409G03RikQ8C5U0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
4933409G03RikQ8C5U0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
4933409G03RikQ8C5U0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
4933409G03RikQ8C5U0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
4933409G03RikQ8C5U0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
4933409G03RikQ8C5U0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
4933409G03RikQ8C5U0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
4933409G03RikQ8C5U0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
4933409G03RikQ8C5U0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
4933409G03RikQ8C5U0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
4933409G03RikQ8C5U0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
4933409G03RikQ8C5U0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
4933409G03RikQ8C5U0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
4933409G03RikQ8C5U0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
4933409G03RikQ8C5U0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
4933409G03RikQ8C5U0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
4933409G03RikQ8C5U0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
4933409G03RikQ8C5U0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
4933409G03RikQ8C5U0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
4933409G03RikQ8C5U0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
4933409G03RikQ8C5U0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
4933409G03RikQ8C5U0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
4933409G03RikQ8C5U0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
4933409G03RikQ8C5U0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
4933409G03RikQ8C5U0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
4933409G03RikQ8C5U0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
4933409G03RikQ8C5U0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
4933409G03RikQ8C5U0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
4933409G03RikQ8C5U0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
4933409G03RikQ8C5U0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
4933409G03RikQ8C5U0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
4933409G03RikQ8C5U0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
4933409G03RikQ8C5U0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
4933409G03RikQ8C5U0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
4933409G03RikQ8C5U0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
4933409G03RikQ8C5U0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
4933409G03RikQ8C5U0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
4933409G03RikQ8C5U0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
4933409G03RikQ8C5U0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
4933409G03RikQ8C5U0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
4933409G03RikQ8C5U0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
4933409G03RikQ8C5U0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4933409G03RikQ8C5U0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4933409G03RikQ8C5U0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4933409G03RikQ8C5U0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
4933409G03RikQ8C5U0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27■■□□□ 1.91
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
4933409G03RikQ8C5U0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
4933409G03RikQ8C5U0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
4933409G03RikQ8C5U0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4933409G03RikQ8C5U0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
4933409G03RikQ8C5U0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
4933409G03RikQ8C5U0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
4933409G03RikQ8C5U0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
4933409G03RikQ8C5U0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
4933409G03RikQ8C5U0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
4933409G03RikQ8C5U0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
4933409G03RikQ8C5U0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
4933409G03RikQ8C5U0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4933409G03RikQ8C5U0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4933409G03RikQ8C5U0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4933409G03RikQ8C5U0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
4933409G03RikQ8C5U0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
4933409G03RikQ8C5U0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
4933409G03RikQ8C5U0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
4933409G03RikQ8C5U0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
4933409G03RikQ8C5U0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
4933409G03RikQ8C5U0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
4933409G03RikQ8C5U0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
4933409G03RikQ8C5U0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
4933409G03RikQ8C5U0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
4933409G03RikQ8C5U0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
4933409G03RikQ8C5U0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms