Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot2Q8C5L3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot2Q8C5L3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot2Q8C5L3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot2Q8C5L3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot2Q8C5L3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot2Q8C5L3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot2Q8C5L3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot2Q8C5L3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot2Q8C5L3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot2Q8C5L3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnot2Q8C5L3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot2Q8C5L3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot2Q8C5L3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot2Q8C5L3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnot2Q8C5L3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot2Q8C5L3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot2Q8C5L3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnot2Q8C5L3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot2Q8C5L3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot2Q8C5L3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot2Q8C5L3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnot2Q8C5L3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnot2Q8C5L3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnot2Q8C5L3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnot2Q8C5L3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnot2Q8C5L3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnot2Q8C5L3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnot2Q8C5L3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnot2Q8C5L3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnot2Q8C5L3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnot2Q8C5L3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnot2Q8C5L3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnot2Q8C5L3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnot2Q8C5L3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot2Q8C5L3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot2Q8C5L3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot2Q8C5L3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot2Q8C5L3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot2Q8C5L3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot2Q8C5L3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot2Q8C5L3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot2Q8C5L3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot2Q8C5L3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot2Q8C5L3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot2Q8C5L3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot2Q8C5L3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot2Q8C5L3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot2Q8C5L3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot2Q8C5L3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot2Q8C5L3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot2Q8C5L3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot2Q8C5L3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot2Q8C5L3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot2Q8C5L3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnot2Q8C5L3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot2Q8C5L3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot2Q8C5L3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot2Q8C5L3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot2Q8C5L3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot2Q8C5L3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot2Q8C5L3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot2Q8C5L3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot2Q8C5L3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot2Q8C5L3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot2Q8C5L3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot2Q8C5L3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot2Q8C5L3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot2Q8C5L3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot2Q8C5L3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot2Q8C5L3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot2Q8C5L3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot2Q8C5L3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot2Q8C5L3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot2Q8C5L3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot2Q8C5L3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot2Q8C5L3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot2Q8C5L3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnot2Q8C5L3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot2Q8C5L3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot2Q8C5L3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot2Q8C5L3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnot2Q8C5L3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnot2Q8C5L3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnot2Q8C5L3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot2Q8C5L3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot2Q8C5L3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot2Q8C5L3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnot2Q8C5L3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnot2Q8C5L3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cnot2Q8C5L3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot2Q8C5L3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot2Q8C5L3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot2Q8C5L3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot2Q8C5L3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot2Q8C5L3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot2Q8C5L3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot2Q8C5L3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot2Q8C5L3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot2Q8C5L3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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