Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FarsaQ8C0C7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FarsaQ8C0C7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FarsaQ8C0C7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FarsaQ8C0C7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FarsaQ8C0C7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FarsaQ8C0C7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FarsaQ8C0C7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FarsaQ8C0C7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FarsaQ8C0C7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FarsaQ8C0C7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FarsaQ8C0C7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FarsaQ8C0C7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FarsaQ8C0C7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FarsaQ8C0C7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FarsaQ8C0C7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FarsaQ8C0C7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FarsaQ8C0C7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FarsaQ8C0C7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FarsaQ8C0C7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FarsaQ8C0C7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FarsaQ8C0C7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FarsaQ8C0C7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FarsaQ8C0C7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FarsaQ8C0C7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FarsaQ8C0C7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FarsaQ8C0C7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FarsaQ8C0C7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FarsaQ8C0C7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FarsaQ8C0C7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FarsaQ8C0C7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FarsaQ8C0C7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FarsaQ8C0C7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FarsaQ8C0C7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FarsaQ8C0C7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FarsaQ8C0C7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FarsaQ8C0C7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FarsaQ8C0C7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FarsaQ8C0C7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FarsaQ8C0C7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FarsaQ8C0C7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FarsaQ8C0C7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FarsaQ8C0C7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FarsaQ8C0C7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FarsaQ8C0C7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FarsaQ8C0C7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FarsaQ8C0C7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FarsaQ8C0C7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FarsaQ8C0C7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FarsaQ8C0C7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FarsaQ8C0C7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FarsaQ8C0C7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FarsaQ8C0C7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FarsaQ8C0C7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FarsaQ8C0C7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FarsaQ8C0C7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FarsaQ8C0C7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FarsaQ8C0C7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FarsaQ8C0C7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FarsaQ8C0C7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FarsaQ8C0C7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FarsaQ8C0C7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FarsaQ8C0C7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FarsaQ8C0C7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FarsaQ8C0C7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FarsaQ8C0C7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FarsaQ8C0C7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FarsaQ8C0C7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FarsaQ8C0C7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FarsaQ8C0C7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FarsaQ8C0C7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FarsaQ8C0C7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FarsaQ8C0C7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FarsaQ8C0C7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FarsaQ8C0C7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FarsaQ8C0C7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FarsaQ8C0C7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FarsaQ8C0C7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FarsaQ8C0C7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FarsaQ8C0C7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FarsaQ8C0C7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FarsaQ8C0C7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FarsaQ8C0C7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FarsaQ8C0C7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FarsaQ8C0C7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FarsaQ8C0C7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FarsaQ8C0C7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FarsaQ8C0C7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FarsaQ8C0C7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FarsaQ8C0C7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FarsaQ8C0C7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FarsaQ8C0C7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FarsaQ8C0C7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FarsaQ8C0C7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FarsaQ8C0C7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FarsaQ8C0C7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FarsaQ8C0C7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FarsaQ8C0C7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FarsaQ8C0C7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FarsaQ8C0C7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms